Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCM7

Fgg, Fibrinogen gamma chain, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FggQ8VCM7 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FggQ8VCM7 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FggQ8VCM7 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FggQ8VCM7 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FggQ8VCM7 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FggQ8VCM7 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FggQ8VCM7 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FggQ8VCM7 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FggQ8VCM7 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FggQ8VCM7 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FggQ8VCM7 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FggQ8VCM7 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
FggQ8VCM7 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FggQ8VCM7 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
FggQ8VCM7 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FggQ8VCM7 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FggQ8VCM7 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FggQ8VCM7 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FggQ8VCM7 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FggQ8VCM7 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FggQ8VCM7 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FggQ8VCM7 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FggQ8VCM7 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FggQ8VCM7 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FggQ8VCM7 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FggQ8VCM7 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FggQ8VCM7 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FggQ8VCM7 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FggQ8VCM7 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FggQ8VCM7 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FggQ8VCM7 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FggQ8VCM7 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FggQ8VCM7 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FggQ8VCM7 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FggQ8VCM7 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FggQ8VCM7 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FggQ8VCM7 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FggQ8VCM7 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FggQ8VCM7 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FggQ8VCM7 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FggQ8VCM7 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FggQ8VCM7 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FggQ8VCM7 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FggQ8VCM7 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FggQ8VCM7 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FggQ8VCM7 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FggQ8VCM7 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FggQ8VCM7 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FggQ8VCM7 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FggQ8VCM7 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FggQ8VCM7 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FggQ8VCM7 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FggQ8VCM7 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FggQ8VCM7 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FggQ8VCM7 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FggQ8VCM7 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FggQ8VCM7 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FggQ8VCM7 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FggQ8VCM7 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FggQ8VCM7 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FggQ8VCM7 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FggQ8VCM7 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FggQ8VCM7 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FggQ8VCM7 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FggQ8VCM7 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FggQ8VCM7 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FggQ8VCM7 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FggQ8VCM7 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FggQ8VCM7 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FggQ8VCM7 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FggQ8VCM7 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FggQ8VCM7 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FggQ8VCM7 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FggQ8VCM7 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FggQ8VCM7 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FggQ8VCM7 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FggQ8VCM7 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FggQ8VCM7 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FggQ8VCM7 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FggQ8VCM7 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FggQ8VCM7 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FggQ8VCM7 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FggQ8VCM7 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FggQ8VCM7 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
FggQ8VCM7 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
FggQ8VCM7 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FggQ8VCM7 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FggQ8VCM7 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
FggQ8VCM7 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FggQ8VCM7 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FggQ8VCM7 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FggQ8VCM7 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FggQ8VCM7 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FggQ8VCM7 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FggQ8VCM7 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FggQ8VCM7 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FggQ8VCM7 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FggQ8VCM7 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FggQ8VCM7 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FggQ8VCM7 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms