Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCD5

Med17, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 17, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med17Q8VCD5 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Med17Q8VCD5 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Med17Q8VCD5 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Med17Q8VCD5 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Med17Q8VCD5 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Med17Q8VCD5 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Med17Q8VCD5 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Med17Q8VCD5 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Med17Q8VCD5 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Med17Q8VCD5 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Med17Q8VCD5 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Med17Q8VCD5 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Med17Q8VCD5 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Med17Q8VCD5 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Med17Q8VCD5 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Med17Q8VCD5 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Med17Q8VCD5 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Med17Q8VCD5 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Med17Q8VCD5 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Med17Q8VCD5 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Med17Q8VCD5 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Med17Q8VCD5 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Med17Q8VCD5 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Med17Q8VCD5 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Med17Q8VCD5 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Med17Q8VCD5 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Med17Q8VCD5 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Med17Q8VCD5 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Med17Q8VCD5 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Med17Q8VCD5 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Med17Q8VCD5 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Med17Q8VCD5 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Med17Q8VCD5 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Med17Q8VCD5 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Med17Q8VCD5 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Med17Q8VCD5 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Med17Q8VCD5 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Med17Q8VCD5 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Med17Q8VCD5 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Med17Q8VCD5 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Med17Q8VCD5 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Med17Q8VCD5 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Med17Q8VCD5 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Med17Q8VCD5 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Med17Q8VCD5 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Med17Q8VCD5 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Med17Q8VCD5 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Med17Q8VCD5 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Med17Q8VCD5 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Med17Q8VCD5 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Med17Q8VCD5 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Med17Q8VCD5 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Med17Q8VCD5 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Med17Q8VCD5 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Med17Q8VCD5 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Med17Q8VCD5 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Med17Q8VCD5 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Med17Q8VCD5 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Med17Q8VCD5 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Med17Q8VCD5 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Med17Q8VCD5 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Med17Q8VCD5 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Med17Q8VCD5 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Med17Q8VCD5 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Med17Q8VCD5 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Med17Q8VCD5 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Med17Q8VCD5 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Med17Q8VCD5 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Med17Q8VCD5 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Med17Q8VCD5 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Med17Q8VCD5 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Med17Q8VCD5 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Med17Q8VCD5 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Med17Q8VCD5 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Med17Q8VCD5 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Med17Q8VCD5 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Med17Q8VCD5 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Med17Q8VCD5 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Med17Q8VCD5 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Med17Q8VCD5 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Med17Q8VCD5 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Med17Q8VCD5 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Med17Q8VCD5 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Med17Q8VCD5 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Med17Q8VCD5 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Med17Q8VCD5 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Med17Q8VCD5 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Med17Q8VCD5 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Med17Q8VCD5 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Med17Q8VCD5 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Med17Q8VCD5 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Med17Q8VCD5 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Med17Q8VCD5 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Med17Q8VCD5 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Med17Q8VCD5 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Med17Q8VCD5 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Med17Q8VCD5 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Med17Q8VCD5 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Med17Q8VCD5 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Med17Q8VCD5 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms