Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCC8

Rapgef3, Rap guanine nucleotide exchange factor 3, mousemouse

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Length 918 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rapgef3Q8VCC8 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rapgef3Q8VCC8 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rapgef3Q8VCC8 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rapgef3Q8VCC8 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rapgef3Q8VCC8 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rapgef3Q8VCC8 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rapgef3Q8VCC8 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Rapgef3Q8VCC8 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rapgef3Q8VCC8 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rapgef3Q8VCC8 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rapgef3Q8VCC8 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rapgef3Q8VCC8 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rapgef3Q8VCC8 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rapgef3Q8VCC8 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rapgef3Q8VCC8 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rapgef3Q8VCC8 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rapgef3Q8VCC8 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rapgef3Q8VCC8 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rapgef3Q8VCC8 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rapgef3Q8VCC8 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rapgef3Q8VCC8 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rapgef3Q8VCC8 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rapgef3Q8VCC8 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rapgef3Q8VCC8 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Rapgef3Q8VCC8 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rapgef3Q8VCC8 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rapgef3Q8VCC8 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rapgef3Q8VCC8 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rapgef3Q8VCC8 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rapgef3Q8VCC8 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rapgef3Q8VCC8 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rapgef3Q8VCC8 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rapgef3Q8VCC8 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rapgef3Q8VCC8 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rapgef3Q8VCC8 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rapgef3Q8VCC8 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rapgef3Q8VCC8 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rapgef3Q8VCC8 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rapgef3Q8VCC8 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Rapgef3Q8VCC8 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rapgef3Q8VCC8 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rapgef3Q8VCC8 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Rapgef3Q8VCC8 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rapgef3Q8VCC8 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rapgef3Q8VCC8 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rapgef3Q8VCC8 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rapgef3Q8VCC8 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rapgef3Q8VCC8 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rapgef3Q8VCC8 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rapgef3Q8VCC8 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rapgef3Q8VCC8 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rapgef3Q8VCC8 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rapgef3Q8VCC8 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Rapgef3Q8VCC8 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rapgef3Q8VCC8 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rapgef3Q8VCC8 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rapgef3Q8VCC8 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rapgef3Q8VCC8 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rapgef3Q8VCC8 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rapgef3Q8VCC8 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rapgef3Q8VCC8 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rapgef3Q8VCC8 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rapgef3Q8VCC8 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rapgef3Q8VCC8 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rapgef3Q8VCC8 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Rapgef3Q8VCC8 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rapgef3Q8VCC8 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rapgef3Q8VCC8 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rapgef3Q8VCC8 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rapgef3Q8VCC8 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rapgef3Q8VCC8 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rapgef3Q8VCC8 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rapgef3Q8VCC8 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rapgef3Q8VCC8 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rapgef3Q8VCC8 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rapgef3Q8VCC8 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rapgef3Q8VCC8 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rapgef3Q8VCC8 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rapgef3Q8VCC8 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Rapgef3Q8VCC8 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rapgef3Q8VCC8 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Rapgef3Q8VCC8 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rapgef3Q8VCC8 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rapgef3Q8VCC8 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rapgef3Q8VCC8 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rapgef3Q8VCC8 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rapgef3Q8VCC8 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rapgef3Q8VCC8 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rapgef3Q8VCC8 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rapgef3Q8VCC8 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Rapgef3Q8VCC8 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Rapgef3Q8VCC8 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Rapgef3Q8VCC8 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rapgef3Q8VCC8 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rapgef3Q8VCC8 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rapgef3Q8VCC8 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rapgef3Q8VCC8 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Rapgef3Q8VCC8 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Rapgef3Q8VCC8 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rapgef3Q8VCC8 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms