Protein–RNA interactions for Protein: Q8VC88

Gca, Grancalcin, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GcaQ8VC88 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
GcaQ8VC88 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
GcaQ8VC88 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
GcaQ8VC88 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
GcaQ8VC88 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
GcaQ8VC88 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
GcaQ8VC88 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
GcaQ8VC88 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
GcaQ8VC88 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
GcaQ8VC88 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
GcaQ8VC88 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
GcaQ8VC88 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
GcaQ8VC88 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
GcaQ8VC88 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
GcaQ8VC88 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
GcaQ8VC88 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
GcaQ8VC88 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
GcaQ8VC88 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
GcaQ8VC88 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
GcaQ8VC88 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
GcaQ8VC88 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
GcaQ8VC88 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
GcaQ8VC88 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
GcaQ8VC88 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GcaQ8VC88 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GcaQ8VC88 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
GcaQ8VC88 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GcaQ8VC88 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
GcaQ8VC88 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GcaQ8VC88 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GcaQ8VC88 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GcaQ8VC88 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
GcaQ8VC88 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GcaQ8VC88 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GcaQ8VC88 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GcaQ8VC88 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GcaQ8VC88 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GcaQ8VC88 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
GcaQ8VC88 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
GcaQ8VC88 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GcaQ8VC88 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GcaQ8VC88 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
GcaQ8VC88 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GcaQ8VC88 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GcaQ8VC88 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
GcaQ8VC88 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GcaQ8VC88 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GcaQ8VC88 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GcaQ8VC88 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GcaQ8VC88 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GcaQ8VC88 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GcaQ8VC88 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GcaQ8VC88 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GcaQ8VC88 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
GcaQ8VC88 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GcaQ8VC88 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GcaQ8VC88 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GcaQ8VC88 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GcaQ8VC88 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GcaQ8VC88 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GcaQ8VC88 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GcaQ8VC88 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GcaQ8VC88 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GcaQ8VC88 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GcaQ8VC88 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GcaQ8VC88 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GcaQ8VC88 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GcaQ8VC88 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
GcaQ8VC88 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GcaQ8VC88 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GcaQ8VC88 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GcaQ8VC88 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GcaQ8VC88 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GcaQ8VC88 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GcaQ8VC88 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
GcaQ8VC88 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GcaQ8VC88 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GcaQ8VC88 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GcaQ8VC88 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GcaQ8VC88 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GcaQ8VC88 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GcaQ8VC88 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GcaQ8VC88 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GcaQ8VC88 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GcaQ8VC88 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
GcaQ8VC88 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GcaQ8VC88 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GcaQ8VC88 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GcaQ8VC88 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GcaQ8VC88 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GcaQ8VC88 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GcaQ8VC88 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GcaQ8VC88 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GcaQ8VC88 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GcaQ8VC88 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GcaQ8VC88 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GcaQ8VC88 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
GcaQ8VC88 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GcaQ8VC88 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
GcaQ8VC88 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms