Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBW5

Bbx, HMG box transcription factor BBX, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BbxQ8VBW5 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BbxQ8VBW5 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BbxQ8VBW5 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BbxQ8VBW5 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BbxQ8VBW5 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BbxQ8VBW5 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BbxQ8VBW5 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BbxQ8VBW5 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BbxQ8VBW5 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BbxQ8VBW5 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BbxQ8VBW5 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BbxQ8VBW5 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BbxQ8VBW5 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BbxQ8VBW5 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BbxQ8VBW5 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BbxQ8VBW5 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BbxQ8VBW5 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BbxQ8VBW5 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BbxQ8VBW5 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BbxQ8VBW5 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BbxQ8VBW5 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BbxQ8VBW5 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BbxQ8VBW5 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
BbxQ8VBW5 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BbxQ8VBW5 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BbxQ8VBW5 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BbxQ8VBW5 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BbxQ8VBW5 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BbxQ8VBW5 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
BbxQ8VBW5 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BbxQ8VBW5 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BbxQ8VBW5 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BbxQ8VBW5 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BbxQ8VBW5 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
BbxQ8VBW5 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BbxQ8VBW5 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BbxQ8VBW5 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BbxQ8VBW5 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BbxQ8VBW5 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BbxQ8VBW5 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BbxQ8VBW5 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BbxQ8VBW5 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BbxQ8VBW5 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BbxQ8VBW5 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BbxQ8VBW5 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BbxQ8VBW5 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BbxQ8VBW5 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BbxQ8VBW5 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
BbxQ8VBW5 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BbxQ8VBW5 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BbxQ8VBW5 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BbxQ8VBW5 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BbxQ8VBW5 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BbxQ8VBW5 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BbxQ8VBW5 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BbxQ8VBW5 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BbxQ8VBW5 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BbxQ8VBW5 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BbxQ8VBW5 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BbxQ8VBW5 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BbxQ8VBW5 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BbxQ8VBW5 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BbxQ8VBW5 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BbxQ8VBW5 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BbxQ8VBW5 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BbxQ8VBW5 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BbxQ8VBW5 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BbxQ8VBW5 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BbxQ8VBW5 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BbxQ8VBW5 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BbxQ8VBW5 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BbxQ8VBW5 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BbxQ8VBW5 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BbxQ8VBW5 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BbxQ8VBW5 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BbxQ8VBW5 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BbxQ8VBW5 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BbxQ8VBW5 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BbxQ8VBW5 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BbxQ8VBW5 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BbxQ8VBW5 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BbxQ8VBW5 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BbxQ8VBW5 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BbxQ8VBW5 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BbxQ8VBW5 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BbxQ8VBW5 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BbxQ8VBW5 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BbxQ8VBW5 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BbxQ8VBW5 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BbxQ8VBW5 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BbxQ8VBW5 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BbxQ8VBW5 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BbxQ8VBW5 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BbxQ8VBW5 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BbxQ8VBW5 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BbxQ8VBW5 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BbxQ8VBW5 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BbxQ8VBW5 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BbxQ8VBW5 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BbxQ8VBW5 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms