Protein–RNA interactions for Protein: Q8R0W1

Cipc, CLOCK-interacting pacemaker, mousemouse

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CipcQ8R0W1 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CipcQ8R0W1 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CipcQ8R0W1 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CipcQ8R0W1 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CipcQ8R0W1 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CipcQ8R0W1 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CipcQ8R0W1 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CipcQ8R0W1 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CipcQ8R0W1 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CipcQ8R0W1 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CipcQ8R0W1 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CipcQ8R0W1 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CipcQ8R0W1 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CipcQ8R0W1 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CipcQ8R0W1 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CipcQ8R0W1 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CipcQ8R0W1 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CipcQ8R0W1 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CipcQ8R0W1 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CipcQ8R0W1 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CipcQ8R0W1 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CipcQ8R0W1 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CipcQ8R0W1 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CipcQ8R0W1 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CipcQ8R0W1 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CipcQ8R0W1 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CipcQ8R0W1 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CipcQ8R0W1 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CipcQ8R0W1 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CipcQ8R0W1 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CipcQ8R0W1 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CipcQ8R0W1 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CipcQ8R0W1 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CipcQ8R0W1 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CipcQ8R0W1 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CipcQ8R0W1 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CipcQ8R0W1 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CipcQ8R0W1 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CipcQ8R0W1 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CipcQ8R0W1 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CipcQ8R0W1 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CipcQ8R0W1 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CipcQ8R0W1 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CipcQ8R0W1 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CipcQ8R0W1 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CipcQ8R0W1 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CipcQ8R0W1 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CipcQ8R0W1 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CipcQ8R0W1 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CipcQ8R0W1 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CipcQ8R0W1 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CipcQ8R0W1 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CipcQ8R0W1 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CipcQ8R0W1 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CipcQ8R0W1 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CipcQ8R0W1 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CipcQ8R0W1 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CipcQ8R0W1 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CipcQ8R0W1 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CipcQ8R0W1 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CipcQ8R0W1 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CipcQ8R0W1 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CipcQ8R0W1 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CipcQ8R0W1 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CipcQ8R0W1 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CipcQ8R0W1 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CipcQ8R0W1 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CipcQ8R0W1 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CipcQ8R0W1 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CipcQ8R0W1 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CipcQ8R0W1 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CipcQ8R0W1 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CipcQ8R0W1 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CipcQ8R0W1 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CipcQ8R0W1 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CipcQ8R0W1 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CipcQ8R0W1 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CipcQ8R0W1 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CipcQ8R0W1 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CipcQ8R0W1 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CipcQ8R0W1 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CipcQ8R0W1 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CipcQ8R0W1 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CipcQ8R0W1 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CipcQ8R0W1 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CipcQ8R0W1 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CipcQ8R0W1 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CipcQ8R0W1 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CipcQ8R0W1 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CipcQ8R0W1 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CipcQ8R0W1 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CipcQ8R0W1 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CipcQ8R0W1 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CipcQ8R0W1 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CipcQ8R0W1 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CipcQ8R0W1 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CipcQ8R0W1 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CipcQ8R0W1 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CipcQ8R0W1 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CipcQ8R0W1 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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