Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZY9

Sf3b4, Splicing factor 3B subunit 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b4Q8QZY9 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Sf3b4Q8QZY9 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sf3b4Q8QZY9 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sf3b4Q8QZY9 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Sf3b4Q8QZY9 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sf3b4Q8QZY9 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sf3b4Q8QZY9 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sf3b4Q8QZY9 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sf3b4Q8QZY9 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sf3b4Q8QZY9 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sf3b4Q8QZY9 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sf3b4Q8QZY9 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sf3b4Q8QZY9 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Sf3b4Q8QZY9 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sf3b4Q8QZY9 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sf3b4Q8QZY9 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sf3b4Q8QZY9 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sf3b4Q8QZY9 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Sf3b4Q8QZY9 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Sf3b4Q8QZY9 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sf3b4Q8QZY9 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Sf3b4Q8QZY9 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sf3b4Q8QZY9 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sf3b4Q8QZY9 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sf3b4Q8QZY9 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sf3b4Q8QZY9 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Sf3b4Q8QZY9 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sf3b4Q8QZY9 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Sf3b4Q8QZY9 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sf3b4Q8QZY9 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sf3b4Q8QZY9 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sf3b4Q8QZY9 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Sf3b4Q8QZY9 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sf3b4Q8QZY9 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sf3b4Q8QZY9 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sf3b4Q8QZY9 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sf3b4Q8QZY9 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sf3b4Q8QZY9 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sf3b4Q8QZY9 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Sf3b4Q8QZY9 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sf3b4Q8QZY9 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sf3b4Q8QZY9 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Sf3b4Q8QZY9 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sf3b4Q8QZY9 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Sf3b4Q8QZY9 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sf3b4Q8QZY9 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sf3b4Q8QZY9 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sf3b4Q8QZY9 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sf3b4Q8QZY9 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sf3b4Q8QZY9 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sf3b4Q8QZY9 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sf3b4Q8QZY9 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sf3b4Q8QZY9 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sf3b4Q8QZY9 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sf3b4Q8QZY9 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sf3b4Q8QZY9 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sf3b4Q8QZY9 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sf3b4Q8QZY9 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sf3b4Q8QZY9 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sf3b4Q8QZY9 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sf3b4Q8QZY9 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Sf3b4Q8QZY9 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Sf3b4Q8QZY9 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sf3b4Q8QZY9 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sf3b4Q8QZY9 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sf3b4Q8QZY9 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sf3b4Q8QZY9 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Sf3b4Q8QZY9 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Sf3b4Q8QZY9 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sf3b4Q8QZY9 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sf3b4Q8QZY9 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sf3b4Q8QZY9 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sf3b4Q8QZY9 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sf3b4Q8QZY9 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sf3b4Q8QZY9 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sf3b4Q8QZY9 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sf3b4Q8QZY9 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sf3b4Q8QZY9 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sf3b4Q8QZY9 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Sf3b4Q8QZY9 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Sf3b4Q8QZY9 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sf3b4Q8QZY9 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sf3b4Q8QZY9 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sf3b4Q8QZY9 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Sf3b4Q8QZY9 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sf3b4Q8QZY9 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Sf3b4Q8QZY9 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Sf3b4Q8QZY9 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sf3b4Q8QZY9 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sf3b4Q8QZY9 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Sf3b4Q8QZY9 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Sf3b4Q8QZY9 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Sf3b4Q8QZY9 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sf3b4Q8QZY9 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sf3b4Q8QZY9 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Sf3b4Q8QZY9 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sf3b4Q8QZY9 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Sf3b4Q8QZY9 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sf3b4Q8QZY9 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sf3b4Q8QZY9 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms