Protein–RNA interactions for Protein: Q8K5B8

Hoxc12, Homeobox protein Hox-C12, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc12Q8K5B8 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxc12Q8K5B8 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxc12Q8K5B8 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxc12Q8K5B8 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxc12Q8K5B8 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxc12Q8K5B8 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxc12Q8K5B8 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxc12Q8K5B8 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxc12Q8K5B8 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxc12Q8K5B8 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxc12Q8K5B8 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Hoxc12Q8K5B8 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Hoxc12Q8K5B8 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Hoxc12Q8K5B8 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Hoxc12Q8K5B8 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Hoxc12Q8K5B8 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Hoxc12Q8K5B8 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxc12Q8K5B8 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxc12Q8K5B8 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxc12Q8K5B8 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxc12Q8K5B8 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxc12Q8K5B8 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxc12Q8K5B8 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxc12Q8K5B8 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxc12Q8K5B8 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxc12Q8K5B8 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxc12Q8K5B8 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxc12Q8K5B8 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxc12Q8K5B8 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxc12Q8K5B8 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxc12Q8K5B8 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxc12Q8K5B8 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxc12Q8K5B8 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxc12Q8K5B8 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxc12Q8K5B8 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxc12Q8K5B8 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxc12Q8K5B8 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxc12Q8K5B8 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxc12Q8K5B8 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxc12Q8K5B8 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxc12Q8K5B8 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxc12Q8K5B8 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxc12Q8K5B8 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxc12Q8K5B8 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxc12Q8K5B8 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxc12Q8K5B8 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxc12Q8K5B8 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxc12Q8K5B8 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxc12Q8K5B8 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxc12Q8K5B8 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxc12Q8K5B8 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxc12Q8K5B8 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxc12Q8K5B8 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxc12Q8K5B8 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxc12Q8K5B8 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxc12Q8K5B8 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxc12Q8K5B8 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxc12Q8K5B8 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxc12Q8K5B8 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxc12Q8K5B8 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxc12Q8K5B8 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxc12Q8K5B8 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxc12Q8K5B8 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxc12Q8K5B8 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxc12Q8K5B8 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxc12Q8K5B8 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxc12Q8K5B8 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxc12Q8K5B8 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxc12Q8K5B8 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxc12Q8K5B8 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxc12Q8K5B8 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxc12Q8K5B8 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxc12Q8K5B8 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxc12Q8K5B8 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxc12Q8K5B8 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxc12Q8K5B8 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxc12Q8K5B8 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxc12Q8K5B8 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxc12Q8K5B8 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxc12Q8K5B8 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxc12Q8K5B8 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxc12Q8K5B8 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxc12Q8K5B8 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxc12Q8K5B8 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxc12Q8K5B8 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxc12Q8K5B8 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxc12Q8K5B8 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxc12Q8K5B8 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxc12Q8K5B8 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxc12Q8K5B8 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxc12Q8K5B8 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxc12Q8K5B8 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxc12Q8K5B8 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxc12Q8K5B8 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxc12Q8K5B8 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxc12Q8K5B8 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxc12Q8K5B8 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxc12Q8K5B8 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxc12Q8K5B8 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxc12Q8K5B8 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms