Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3Y3

Lin28a, Protein lin-28 homolog A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lin28aQ8K3Y3 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Lin28aQ8K3Y3 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Lin28aQ8K3Y3 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Lin28aQ8K3Y3 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Lin28aQ8K3Y3 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Lin28aQ8K3Y3 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Lin28aQ8K3Y3 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lin28aQ8K3Y3 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lin28aQ8K3Y3 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lin28aQ8K3Y3 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lin28aQ8K3Y3 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lin28aQ8K3Y3 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lin28aQ8K3Y3 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lin28aQ8K3Y3 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lin28aQ8K3Y3 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lin28aQ8K3Y3 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lin28aQ8K3Y3 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lin28aQ8K3Y3 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lin28aQ8K3Y3 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Lin28aQ8K3Y3 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Lin28aQ8K3Y3 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lin28aQ8K3Y3 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lin28aQ8K3Y3 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lin28aQ8K3Y3 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lin28aQ8K3Y3 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lin28aQ8K3Y3 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lin28aQ8K3Y3 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Lin28aQ8K3Y3 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lin28aQ8K3Y3 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lin28aQ8K3Y3 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lin28aQ8K3Y3 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lin28aQ8K3Y3 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lin28aQ8K3Y3 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lin28aQ8K3Y3 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lin28aQ8K3Y3 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lin28aQ8K3Y3 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lin28aQ8K3Y3 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lin28aQ8K3Y3 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lin28aQ8K3Y3 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lin28aQ8K3Y3 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lin28aQ8K3Y3 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Lin28aQ8K3Y3 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lin28aQ8K3Y3 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lin28aQ8K3Y3 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Lin28aQ8K3Y3 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Lin28aQ8K3Y3 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Lin28aQ8K3Y3 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lin28aQ8K3Y3 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lin28aQ8K3Y3 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lin28aQ8K3Y3 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lin28aQ8K3Y3 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lin28aQ8K3Y3 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lin28aQ8K3Y3 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lin28aQ8K3Y3 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Lin28aQ8K3Y3 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lin28aQ8K3Y3 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lin28aQ8K3Y3 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lin28aQ8K3Y3 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lin28aQ8K3Y3 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lin28aQ8K3Y3 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lin28aQ8K3Y3 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lin28aQ8K3Y3 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lin28aQ8K3Y3 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lin28aQ8K3Y3 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lin28aQ8K3Y3 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lin28aQ8K3Y3 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lin28aQ8K3Y3 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lin28aQ8K3Y3 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lin28aQ8K3Y3 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lin28aQ8K3Y3 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lin28aQ8K3Y3 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lin28aQ8K3Y3 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lin28aQ8K3Y3 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lin28aQ8K3Y3 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lin28aQ8K3Y3 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Lin28aQ8K3Y3 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Lin28aQ8K3Y3 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Lin28aQ8K3Y3 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lin28aQ8K3Y3 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lin28aQ8K3Y3 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lin28aQ8K3Y3 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lin28aQ8K3Y3 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lin28aQ8K3Y3 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lin28aQ8K3Y3 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lin28aQ8K3Y3 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lin28aQ8K3Y3 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lin28aQ8K3Y3 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lin28aQ8K3Y3 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lin28aQ8K3Y3 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lin28aQ8K3Y3 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lin28aQ8K3Y3 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lin28aQ8K3Y3 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lin28aQ8K3Y3 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Lin28aQ8K3Y3 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lin28aQ8K3Y3 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Lin28aQ8K3Y3 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Lin28aQ8K3Y3 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lin28aQ8K3Y3 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lin28aQ8K3Y3 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lin28aQ8K3Y3 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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