Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3W3

Casc3, Protein CASC3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 698 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casc3Q8K3W3 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Casc3Q8K3W3 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Casc3Q8K3W3 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Casc3Q8K3W3 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Casc3Q8K3W3 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Casc3Q8K3W3 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Casc3Q8K3W3 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Casc3Q8K3W3 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Casc3Q8K3W3 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Casc3Q8K3W3 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Casc3Q8K3W3 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Casc3Q8K3W3 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Casc3Q8K3W3 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Casc3Q8K3W3 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Casc3Q8K3W3 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Casc3Q8K3W3 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Casc3Q8K3W3 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Casc3Q8K3W3 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Casc3Q8K3W3 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Casc3Q8K3W3 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Casc3Q8K3W3 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Casc3Q8K3W3 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Casc3Q8K3W3 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Casc3Q8K3W3 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Casc3Q8K3W3 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Casc3Q8K3W3 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Casc3Q8K3W3 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Casc3Q8K3W3 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Casc3Q8K3W3 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Casc3Q8K3W3 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Casc3Q8K3W3 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Casc3Q8K3W3 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Casc3Q8K3W3 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Casc3Q8K3W3 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Casc3Q8K3W3 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Casc3Q8K3W3 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Casc3Q8K3W3 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Casc3Q8K3W3 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Casc3Q8K3W3 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Casc3Q8K3W3 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Casc3Q8K3W3 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Casc3Q8K3W3 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Casc3Q8K3W3 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Casc3Q8K3W3 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Casc3Q8K3W3 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Casc3Q8K3W3 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Casc3Q8K3W3 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Casc3Q8K3W3 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Casc3Q8K3W3 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Casc3Q8K3W3 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Casc3Q8K3W3 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Casc3Q8K3W3 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Casc3Q8K3W3 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Casc3Q8K3W3 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Casc3Q8K3W3 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Casc3Q8K3W3 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Casc3Q8K3W3 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Casc3Q8K3W3 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Casc3Q8K3W3 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Casc3Q8K3W3 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Casc3Q8K3W3 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Casc3Q8K3W3 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Casc3Q8K3W3 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Casc3Q8K3W3 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Casc3Q8K3W3 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Casc3Q8K3W3 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Casc3Q8K3W3 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Casc3Q8K3W3 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Casc3Q8K3W3 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Casc3Q8K3W3 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Casc3Q8K3W3 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Casc3Q8K3W3 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Casc3Q8K3W3 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Casc3Q8K3W3 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Casc3Q8K3W3 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Casc3Q8K3W3 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Casc3Q8K3W3 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Casc3Q8K3W3 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Casc3Q8K3W3 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Casc3Q8K3W3 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Casc3Q8K3W3 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Casc3Q8K3W3 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Casc3Q8K3W3 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Casc3Q8K3W3 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Casc3Q8K3W3 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Casc3Q8K3W3 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Casc3Q8K3W3 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Casc3Q8K3W3 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Casc3Q8K3W3 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Casc3Q8K3W3 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Casc3Q8K3W3 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Casc3Q8K3W3 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Casc3Q8K3W3 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Casc3Q8K3W3 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Casc3Q8K3W3 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Casc3Q8K3W3 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Casc3Q8K3W3 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Casc3Q8K3W3 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Casc3Q8K3W3 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Casc3Q8K3W3 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms