Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3I4

Myrip, Rab effector MyRIP, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MyripQ8K3I4 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
MyripQ8K3I4 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MyripQ8K3I4 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MyripQ8K3I4 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MyripQ8K3I4 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
MyripQ8K3I4 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MyripQ8K3I4 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MyripQ8K3I4 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MyripQ8K3I4 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MyripQ8K3I4 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
MyripQ8K3I4 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MyripQ8K3I4 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MyripQ8K3I4 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MyripQ8K3I4 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MyripQ8K3I4 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MyripQ8K3I4 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MyripQ8K3I4 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MyripQ8K3I4 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MyripQ8K3I4 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MyripQ8K3I4 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MyripQ8K3I4 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MyripQ8K3I4 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MyripQ8K3I4 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MyripQ8K3I4 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MyripQ8K3I4 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MyripQ8K3I4 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MyripQ8K3I4 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MyripQ8K3I4 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MyripQ8K3I4 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MyripQ8K3I4 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MyripQ8K3I4 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MyripQ8K3I4 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MyripQ8K3I4 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MyripQ8K3I4 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
MyripQ8K3I4 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MyripQ8K3I4 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MyripQ8K3I4 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MyripQ8K3I4 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
MyripQ8K3I4 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MyripQ8K3I4 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MyripQ8K3I4 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MyripQ8K3I4 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MyripQ8K3I4 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MyripQ8K3I4 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
MyripQ8K3I4 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
MyripQ8K3I4 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MyripQ8K3I4 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MyripQ8K3I4 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MyripQ8K3I4 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MyripQ8K3I4 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MyripQ8K3I4 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MyripQ8K3I4 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MyripQ8K3I4 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MyripQ8K3I4 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MyripQ8K3I4 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MyripQ8K3I4 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MyripQ8K3I4 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MyripQ8K3I4 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MyripQ8K3I4 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MyripQ8K3I4 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MyripQ8K3I4 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MyripQ8K3I4 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MyripQ8K3I4 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MyripQ8K3I4 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MyripQ8K3I4 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
MyripQ8K3I4 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
MyripQ8K3I4 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MyripQ8K3I4 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MyripQ8K3I4 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MyripQ8K3I4 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MyripQ8K3I4 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
MyripQ8K3I4 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MyripQ8K3I4 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MyripQ8K3I4 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MyripQ8K3I4 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MyripQ8K3I4 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MyripQ8K3I4 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MyripQ8K3I4 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MyripQ8K3I4 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MyripQ8K3I4 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MyripQ8K3I4 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MyripQ8K3I4 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MyripQ8K3I4 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MyripQ8K3I4 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MyripQ8K3I4 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MyripQ8K3I4 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MyripQ8K3I4 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MyripQ8K3I4 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MyripQ8K3I4 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MyripQ8K3I4 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MyripQ8K3I4 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MyripQ8K3I4 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MyripQ8K3I4 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MyripQ8K3I4 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MyripQ8K3I4 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MyripQ8K3I4 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MyripQ8K3I4 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MyripQ8K3I4 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MyripQ8K3I4 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MyripQ8K3I4 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms