Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Y9

Ccm2, Cerebral cavernous malformations protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccm2Q8K2Y9 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccm2Q8K2Y9 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccm2Q8K2Y9 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccm2Q8K2Y9 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccm2Q8K2Y9 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccm2Q8K2Y9 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccm2Q8K2Y9 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccm2Q8K2Y9 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccm2Q8K2Y9 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccm2Q8K2Y9 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccm2Q8K2Y9 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccm2Q8K2Y9 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccm2Q8K2Y9 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccm2Q8K2Y9 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccm2Q8K2Y9 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccm2Q8K2Y9 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccm2Q8K2Y9 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccm2Q8K2Y9 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccm2Q8K2Y9 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccm2Q8K2Y9 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccm2Q8K2Y9 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccm2Q8K2Y9 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccm2Q8K2Y9 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccm2Q8K2Y9 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccm2Q8K2Y9 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccm2Q8K2Y9 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccm2Q8K2Y9 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccm2Q8K2Y9 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccm2Q8K2Y9 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccm2Q8K2Y9 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccm2Q8K2Y9 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccm2Q8K2Y9 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccm2Q8K2Y9 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccm2Q8K2Y9 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccm2Q8K2Y9 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccm2Q8K2Y9 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccm2Q8K2Y9 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccm2Q8K2Y9 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccm2Q8K2Y9 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccm2Q8K2Y9 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccm2Q8K2Y9 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccm2Q8K2Y9 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccm2Q8K2Y9 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccm2Q8K2Y9 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccm2Q8K2Y9 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccm2Q8K2Y9 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccm2Q8K2Y9 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccm2Q8K2Y9 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccm2Q8K2Y9 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccm2Q8K2Y9 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccm2Q8K2Y9 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccm2Q8K2Y9 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccm2Q8K2Y9 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccm2Q8K2Y9 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccm2Q8K2Y9 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccm2Q8K2Y9 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccm2Q8K2Y9 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccm2Q8K2Y9 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccm2Q8K2Y9 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccm2Q8K2Y9 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccm2Q8K2Y9 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccm2Q8K2Y9 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccm2Q8K2Y9 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccm2Q8K2Y9 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccm2Q8K2Y9 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccm2Q8K2Y9 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccm2Q8K2Y9 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccm2Q8K2Y9 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccm2Q8K2Y9 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccm2Q8K2Y9 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccm2Q8K2Y9 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccm2Q8K2Y9 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccm2Q8K2Y9 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccm2Q8K2Y9 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccm2Q8K2Y9 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccm2Q8K2Y9 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccm2Q8K2Y9 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccm2Q8K2Y9 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccm2Q8K2Y9 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccm2Q8K2Y9 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccm2Q8K2Y9 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccm2Q8K2Y9 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccm2Q8K2Y9 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccm2Q8K2Y9 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccm2Q8K2Y9 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccm2Q8K2Y9 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccm2Q8K2Y9 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccm2Q8K2Y9 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccm2Q8K2Y9 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccm2Q8K2Y9 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccm2Q8K2Y9 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccm2Q8K2Y9 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccm2Q8K2Y9 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccm2Q8K2Y9 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccm2Q8K2Y9 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccm2Q8K2Y9 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccm2Q8K2Y9 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccm2Q8K2Y9 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccm2Q8K2Y9 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccm2Q8K2Y9 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms