Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Y0

Rnf219, RING finger protein 219, mousemouse

Predictions only

Length 722 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf219Q8K2Y0 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rnf219Q8K2Y0 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf219Q8K2Y0 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf219Q8K2Y0 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf219Q8K2Y0 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf219Q8K2Y0 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf219Q8K2Y0 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf219Q8K2Y0 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf219Q8K2Y0 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf219Q8K2Y0 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf219Q8K2Y0 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf219Q8K2Y0 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf219Q8K2Y0 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf219Q8K2Y0 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf219Q8K2Y0 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf219Q8K2Y0 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf219Q8K2Y0 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf219Q8K2Y0 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf219Q8K2Y0 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf219Q8K2Y0 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf219Q8K2Y0 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf219Q8K2Y0 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf219Q8K2Y0 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf219Q8K2Y0 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf219Q8K2Y0 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf219Q8K2Y0 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf219Q8K2Y0 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf219Q8K2Y0 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf219Q8K2Y0 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf219Q8K2Y0 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf219Q8K2Y0 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf219Q8K2Y0 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rnf219Q8K2Y0 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf219Q8K2Y0 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf219Q8K2Y0 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf219Q8K2Y0 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf219Q8K2Y0 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf219Q8K2Y0 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf219Q8K2Y0 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf219Q8K2Y0 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf219Q8K2Y0 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf219Q8K2Y0 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf219Q8K2Y0 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf219Q8K2Y0 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf219Q8K2Y0 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf219Q8K2Y0 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf219Q8K2Y0 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf219Q8K2Y0 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf219Q8K2Y0 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf219Q8K2Y0 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf219Q8K2Y0 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf219Q8K2Y0 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf219Q8K2Y0 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf219Q8K2Y0 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf219Q8K2Y0 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf219Q8K2Y0 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf219Q8K2Y0 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf219Q8K2Y0 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf219Q8K2Y0 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf219Q8K2Y0 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf219Q8K2Y0 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf219Q8K2Y0 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf219Q8K2Y0 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf219Q8K2Y0 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf219Q8K2Y0 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf219Q8K2Y0 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf219Q8K2Y0 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf219Q8K2Y0 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf219Q8K2Y0 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf219Q8K2Y0 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf219Q8K2Y0 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf219Q8K2Y0 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf219Q8K2Y0 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf219Q8K2Y0 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf219Q8K2Y0 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf219Q8K2Y0 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf219Q8K2Y0 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf219Q8K2Y0 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf219Q8K2Y0 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf219Q8K2Y0 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf219Q8K2Y0 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf219Q8K2Y0 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf219Q8K2Y0 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf219Q8K2Y0 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf219Q8K2Y0 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf219Q8K2Y0 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf219Q8K2Y0 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf219Q8K2Y0 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf219Q8K2Y0 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf219Q8K2Y0 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf219Q8K2Y0 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf219Q8K2Y0 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf219Q8K2Y0 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf219Q8K2Y0 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf219Q8K2Y0 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf219Q8K2Y0 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf219Q8K2Y0 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf219Q8K2Y0 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf219Q8K2Y0 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf219Q8K2Y0 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms