Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2L8

Trappc12, Trafficking protein particle complex subunit 12, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc12Q8K2L8 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trappc12Q8K2L8 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trappc12Q8K2L8 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trappc12Q8K2L8 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trappc12Q8K2L8 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trappc12Q8K2L8 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trappc12Q8K2L8 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Trappc12Q8K2L8 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trappc12Q8K2L8 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trappc12Q8K2L8 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trappc12Q8K2L8 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trappc12Q8K2L8 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Trappc12Q8K2L8 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trappc12Q8K2L8 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Trappc12Q8K2L8 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trappc12Q8K2L8 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trappc12Q8K2L8 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trappc12Q8K2L8 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trappc12Q8K2L8 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trappc12Q8K2L8 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trappc12Q8K2L8 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trappc12Q8K2L8 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trappc12Q8K2L8 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trappc12Q8K2L8 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trappc12Q8K2L8 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trappc12Q8K2L8 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trappc12Q8K2L8 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trappc12Q8K2L8 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trappc12Q8K2L8 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trappc12Q8K2L8 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trappc12Q8K2L8 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trappc12Q8K2L8 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trappc12Q8K2L8 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trappc12Q8K2L8 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trappc12Q8K2L8 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trappc12Q8K2L8 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trappc12Q8K2L8 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trappc12Q8K2L8 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trappc12Q8K2L8 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trappc12Q8K2L8 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trappc12Q8K2L8 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trappc12Q8K2L8 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trappc12Q8K2L8 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trappc12Q8K2L8 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trappc12Q8K2L8 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trappc12Q8K2L8 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trappc12Q8K2L8 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trappc12Q8K2L8 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trappc12Q8K2L8 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trappc12Q8K2L8 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trappc12Q8K2L8 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trappc12Q8K2L8 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trappc12Q8K2L8 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trappc12Q8K2L8 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trappc12Q8K2L8 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trappc12Q8K2L8 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trappc12Q8K2L8 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trappc12Q8K2L8 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Trappc12Q8K2L8 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trappc12Q8K2L8 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trappc12Q8K2L8 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trappc12Q8K2L8 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trappc12Q8K2L8 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trappc12Q8K2L8 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trappc12Q8K2L8 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trappc12Q8K2L8 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trappc12Q8K2L8 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trappc12Q8K2L8 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trappc12Q8K2L8 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trappc12Q8K2L8 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trappc12Q8K2L8 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trappc12Q8K2L8 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trappc12Q8K2L8 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trappc12Q8K2L8 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Trappc12Q8K2L8 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Trappc12Q8K2L8 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Trappc12Q8K2L8 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Trappc12Q8K2L8 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Trappc12Q8K2L8 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Trappc12Q8K2L8 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Trappc12Q8K2L8 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trappc12Q8K2L8 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trappc12Q8K2L8 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trappc12Q8K2L8 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trappc12Q8K2L8 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Trappc12Q8K2L8 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trappc12Q8K2L8 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trappc12Q8K2L8 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trappc12Q8K2L8 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trappc12Q8K2L8 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trappc12Q8K2L8 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trappc12Q8K2L8 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trappc12Q8K2L8 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trappc12Q8K2L8 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trappc12Q8K2L8 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trappc12Q8K2L8 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trappc12Q8K2L8 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trappc12Q8K2L8 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trappc12Q8K2L8 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trappc12Q8K2L8 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms