Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2F0

Brd3, Bromodomain-containing protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd3Q8K2F0 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Brd3Q8K2F0 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Brd3Q8K2F0 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Brd3Q8K2F0 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Brd3Q8K2F0 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Brd3Q8K2F0 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Brd3Q8K2F0 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Brd3Q8K2F0 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Brd3Q8K2F0 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Brd3Q8K2F0 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Brd3Q8K2F0 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Brd3Q8K2F0 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Brd3Q8K2F0 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Brd3Q8K2F0 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Brd3Q8K2F0 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Brd3Q8K2F0 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Brd3Q8K2F0 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Brd3Q8K2F0 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Brd3Q8K2F0 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Brd3Q8K2F0 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Brd3Q8K2F0 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Brd3Q8K2F0 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Brd3Q8K2F0 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Brd3Q8K2F0 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Brd3Q8K2F0 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Brd3Q8K2F0 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Brd3Q8K2F0 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Brd3Q8K2F0 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Brd3Q8K2F0 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Brd3Q8K2F0 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Brd3Q8K2F0 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Brd3Q8K2F0 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Brd3Q8K2F0 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Brd3Q8K2F0 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Brd3Q8K2F0 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Brd3Q8K2F0 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Brd3Q8K2F0 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Brd3Q8K2F0 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Brd3Q8K2F0 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Brd3Q8K2F0 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Brd3Q8K2F0 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Brd3Q8K2F0 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Brd3Q8K2F0 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Brd3Q8K2F0 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Brd3Q8K2F0 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Brd3Q8K2F0 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Brd3Q8K2F0 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Brd3Q8K2F0 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Brd3Q8K2F0 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Brd3Q8K2F0 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Brd3Q8K2F0 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Brd3Q8K2F0 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Brd3Q8K2F0 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Brd3Q8K2F0 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Brd3Q8K2F0 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Brd3Q8K2F0 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Brd3Q8K2F0 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Brd3Q8K2F0 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Brd3Q8K2F0 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Brd3Q8K2F0 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Brd3Q8K2F0 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Brd3Q8K2F0 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Brd3Q8K2F0 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Brd3Q8K2F0 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Brd3Q8K2F0 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Brd3Q8K2F0 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Brd3Q8K2F0 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Brd3Q8K2F0 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Brd3Q8K2F0 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Brd3Q8K2F0 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Brd3Q8K2F0 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Brd3Q8K2F0 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Brd3Q8K2F0 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Brd3Q8K2F0 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Brd3Q8K2F0 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Brd3Q8K2F0 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Brd3Q8K2F0 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Brd3Q8K2F0 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Brd3Q8K2F0 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Brd3Q8K2F0 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Brd3Q8K2F0 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Brd3Q8K2F0 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Brd3Q8K2F0 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Brd3Q8K2F0 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Brd3Q8K2F0 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Brd3Q8K2F0 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Brd3Q8K2F0 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Brd3Q8K2F0 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Brd3Q8K2F0 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Brd3Q8K2F0 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Brd3Q8K2F0 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Brd3Q8K2F0 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Brd3Q8K2F0 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Brd3Q8K2F0 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Brd3Q8K2F0 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Brd3Q8K2F0 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Brd3Q8K2F0 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Brd3Q8K2F0 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Brd3Q8K2F0 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Brd3Q8K2F0 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms