Protein–RNA interactions for Protein: Q8K296

Mtmr3, Myotubularin-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtmr3Q8K296 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mtmr3Q8K296 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Mtmr3Q8K296 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mtmr3Q8K296 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mtmr3Q8K296 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Mtmr3Q8K296 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mtmr3Q8K296 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mtmr3Q8K296 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mtmr3Q8K296 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mtmr3Q8K296 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mtmr3Q8K296 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mtmr3Q8K296 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mtmr3Q8K296 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mtmr3Q8K296 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mtmr3Q8K296 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mtmr3Q8K296 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mtmr3Q8K296 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mtmr3Q8K296 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mtmr3Q8K296 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mtmr3Q8K296 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mtmr3Q8K296 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mtmr3Q8K296 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mtmr3Q8K296 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mtmr3Q8K296 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mtmr3Q8K296 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mtmr3Q8K296 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mtmr3Q8K296 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mtmr3Q8K296 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mtmr3Q8K296 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mtmr3Q8K296 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mtmr3Q8K296 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mtmr3Q8K296 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mtmr3Q8K296 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mtmr3Q8K296 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mtmr3Q8K296 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mtmr3Q8K296 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mtmr3Q8K296 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mtmr3Q8K296 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mtmr3Q8K296 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mtmr3Q8K296 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mtmr3Q8K296 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mtmr3Q8K296 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Mtmr3Q8K296 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mtmr3Q8K296 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mtmr3Q8K296 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mtmr3Q8K296 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mtmr3Q8K296 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mtmr3Q8K296 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mtmr3Q8K296 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mtmr3Q8K296 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Mtmr3Q8K296 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mtmr3Q8K296 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mtmr3Q8K296 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Mtmr3Q8K296 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mtmr3Q8K296 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mtmr3Q8K296 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mtmr3Q8K296 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mtmr3Q8K296 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mtmr3Q8K296 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mtmr3Q8K296 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mtmr3Q8K296 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mtmr3Q8K296 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mtmr3Q8K296 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mtmr3Q8K296 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mtmr3Q8K296 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mtmr3Q8K296 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mtmr3Q8K296 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mtmr3Q8K296 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mtmr3Q8K296 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mtmr3Q8K296 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mtmr3Q8K296 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mtmr3Q8K296 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mtmr3Q8K296 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mtmr3Q8K296 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mtmr3Q8K296 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mtmr3Q8K296 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mtmr3Q8K296 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mtmr3Q8K296 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mtmr3Q8K296 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mtmr3Q8K296 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mtmr3Q8K296 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mtmr3Q8K296 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mtmr3Q8K296 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mtmr3Q8K296 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mtmr3Q8K296 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Mtmr3Q8K296 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mtmr3Q8K296 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mtmr3Q8K296 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mtmr3Q8K296 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mtmr3Q8K296 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mtmr3Q8K296 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mtmr3Q8K296 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mtmr3Q8K296 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mtmr3Q8K296 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mtmr3Q8K296 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Mtmr3Q8K296 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mtmr3Q8K296 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mtmr3Q8K296 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mtmr3Q8K296 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mtmr3Q8K296 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms