Protein–RNA interactions for Protein: Q8K284

Gtf3c1, General transcription factor 3C polypeptide 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c1Q8K284 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtf3c1Q8K284 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtf3c1Q8K284 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtf3c1Q8K284 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtf3c1Q8K284 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtf3c1Q8K284 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtf3c1Q8K284 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtf3c1Q8K284 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtf3c1Q8K284 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtf3c1Q8K284 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtf3c1Q8K284 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtf3c1Q8K284 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtf3c1Q8K284 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gtf3c1Q8K284 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gtf3c1Q8K284 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gtf3c1Q8K284 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gtf3c1Q8K284 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gtf3c1Q8K284 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gtf3c1Q8K284 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gtf3c1Q8K284 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gtf3c1Q8K284 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gtf3c1Q8K284 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gtf3c1Q8K284 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gtf3c1Q8K284 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gtf3c1Q8K284 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gtf3c1Q8K284 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gtf3c1Q8K284 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gtf3c1Q8K284 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gtf3c1Q8K284 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gtf3c1Q8K284 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gtf3c1Q8K284 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gtf3c1Q8K284 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gtf3c1Q8K284 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gtf3c1Q8K284 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gtf3c1Q8K284 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gtf3c1Q8K284 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gtf3c1Q8K284 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gtf3c1Q8K284 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gtf3c1Q8K284 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gtf3c1Q8K284 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gtf3c1Q8K284 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gtf3c1Q8K284 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gtf3c1Q8K284 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gtf3c1Q8K284 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gtf3c1Q8K284 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gtf3c1Q8K284 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gtf3c1Q8K284 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gtf3c1Q8K284 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gtf3c1Q8K284 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gtf3c1Q8K284 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gtf3c1Q8K284 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gtf3c1Q8K284 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gtf3c1Q8K284 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gtf3c1Q8K284 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gtf3c1Q8K284 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gtf3c1Q8K284 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gtf3c1Q8K284 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gtf3c1Q8K284 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gtf3c1Q8K284 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gtf3c1Q8K284 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gtf3c1Q8K284 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gtf3c1Q8K284 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gtf3c1Q8K284 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gtf3c1Q8K284 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gtf3c1Q8K284 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gtf3c1Q8K284 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gtf3c1Q8K284 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gtf3c1Q8K284 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gtf3c1Q8K284 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gtf3c1Q8K284 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gtf3c1Q8K284 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gtf3c1Q8K284 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gtf3c1Q8K284 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gtf3c1Q8K284 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gtf3c1Q8K284 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gtf3c1Q8K284 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gtf3c1Q8K284 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gtf3c1Q8K284 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gtf3c1Q8K284 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gtf3c1Q8K284 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gtf3c1Q8K284 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gtf3c1Q8K284 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gtf3c1Q8K284 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gtf3c1Q8K284 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gtf3c1Q8K284 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gtf3c1Q8K284 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gtf3c1Q8K284 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gtf3c1Q8K284 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gtf3c1Q8K284 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gtf3c1Q8K284 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gtf3c1Q8K284 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gtf3c1Q8K284 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gtf3c1Q8K284 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gtf3c1Q8K284 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gtf3c1Q8K284 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gtf3c1Q8K284 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gtf3c1Q8K284 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gtf3c1Q8K284 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gtf3c1Q8K284 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gtf3c1Q8K284 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms