Protein–RNA interactions for Protein: Q8K202

Polr1e, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA49, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1eQ8K202 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Polr1eQ8K202 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Polr1eQ8K202 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Polr1eQ8K202 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Polr1eQ8K202 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Polr1eQ8K202 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Polr1eQ8K202 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Polr1eQ8K202 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Polr1eQ8K202 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Polr1eQ8K202 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Polr1eQ8K202 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Polr1eQ8K202 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Polr1eQ8K202 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Polr1eQ8K202 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Polr1eQ8K202 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Polr1eQ8K202 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Polr1eQ8K202 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Polr1eQ8K202 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Polr1eQ8K202 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Polr1eQ8K202 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Polr1eQ8K202 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Polr1eQ8K202 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Polr1eQ8K202 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Polr1eQ8K202 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Polr1eQ8K202 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Polr1eQ8K202 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Polr1eQ8K202 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Polr1eQ8K202 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Polr1eQ8K202 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Polr1eQ8K202 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Polr1eQ8K202 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Polr1eQ8K202 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Polr1eQ8K202 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Polr1eQ8K202 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Polr1eQ8K202 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Polr1eQ8K202 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Polr1eQ8K202 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Polr1eQ8K202 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Polr1eQ8K202 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Polr1eQ8K202 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Polr1eQ8K202 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Polr1eQ8K202 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Polr1eQ8K202 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Polr1eQ8K202 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Polr1eQ8K202 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Polr1eQ8K202 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Polr1eQ8K202 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Polr1eQ8K202 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Polr1eQ8K202 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Polr1eQ8K202 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Polr1eQ8K202 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Polr1eQ8K202 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Polr1eQ8K202 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Polr1eQ8K202 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Polr1eQ8K202 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Polr1eQ8K202 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Polr1eQ8K202 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Polr1eQ8K202 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Polr1eQ8K202 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Polr1eQ8K202 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Polr1eQ8K202 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Polr1eQ8K202 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Polr1eQ8K202 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Polr1eQ8K202 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Polr1eQ8K202 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Polr1eQ8K202 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Polr1eQ8K202 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Polr1eQ8K202 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Polr1eQ8K202 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Polr1eQ8K202 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Polr1eQ8K202 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Polr1eQ8K202 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Polr1eQ8K202 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Polr1eQ8K202 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Polr1eQ8K202 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Polr1eQ8K202 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Polr1eQ8K202 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Polr1eQ8K202 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Polr1eQ8K202 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Polr1eQ8K202 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Polr1eQ8K202 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Polr1eQ8K202 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Polr1eQ8K202 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Polr1eQ8K202 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Polr1eQ8K202 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Polr1eQ8K202 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Polr1eQ8K202 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Polr1eQ8K202 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Polr1eQ8K202 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Polr1eQ8K202 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Polr1eQ8K202 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Polr1eQ8K202 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Polr1eQ8K202 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Polr1eQ8K202 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Polr1eQ8K202 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Polr1eQ8K202 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Polr1eQ8K202 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Polr1eQ8K202 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Polr1eQ8K202 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Polr1eQ8K202 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms