Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0E8

Fgb, Fibrinogen beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FgbQ8K0E8 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FgbQ8K0E8 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FgbQ8K0E8 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FgbQ8K0E8 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FgbQ8K0E8 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FgbQ8K0E8 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FgbQ8K0E8 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FgbQ8K0E8 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
FgbQ8K0E8 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FgbQ8K0E8 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
FgbQ8K0E8 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
FgbQ8K0E8 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
FgbQ8K0E8 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FgbQ8K0E8 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FgbQ8K0E8 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FgbQ8K0E8 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FgbQ8K0E8 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FgbQ8K0E8 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FgbQ8K0E8 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FgbQ8K0E8 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FgbQ8K0E8 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FgbQ8K0E8 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FgbQ8K0E8 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FgbQ8K0E8 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FgbQ8K0E8 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FgbQ8K0E8 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FgbQ8K0E8 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FgbQ8K0E8 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FgbQ8K0E8 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FgbQ8K0E8 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FgbQ8K0E8 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FgbQ8K0E8 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FgbQ8K0E8 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
FgbQ8K0E8 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
FgbQ8K0E8 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FgbQ8K0E8 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FgbQ8K0E8 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FgbQ8K0E8 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FgbQ8K0E8 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FgbQ8K0E8 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FgbQ8K0E8 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FgbQ8K0E8 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FgbQ8K0E8 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
FgbQ8K0E8 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
FgbQ8K0E8 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
FgbQ8K0E8 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
FgbQ8K0E8 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
FgbQ8K0E8 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
FgbQ8K0E8 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
FgbQ8K0E8 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
FgbQ8K0E8 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FgbQ8K0E8 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FgbQ8K0E8 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FgbQ8K0E8 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FgbQ8K0E8 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FgbQ8K0E8 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FgbQ8K0E8 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
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FgbQ8K0E8 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
FgbQ8K0E8 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FgbQ8K0E8 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
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FgbQ8K0E8 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FgbQ8K0E8 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FgbQ8K0E8 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FgbQ8K0E8 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FgbQ8K0E8 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FgbQ8K0E8 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FgbQ8K0E8 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FgbQ8K0E8 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FgbQ8K0E8 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FgbQ8K0E8 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FgbQ8K0E8 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FgbQ8K0E8 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FgbQ8K0E8 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FgbQ8K0E8 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FgbQ8K0E8 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FgbQ8K0E8 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FgbQ8K0E8 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FgbQ8K0E8 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FgbQ8K0E8 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
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FgbQ8K0E8 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FgbQ8K0E8 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FgbQ8K0E8 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FgbQ8K0E8 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FgbQ8K0E8 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FgbQ8K0E8 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FgbQ8K0E8 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FgbQ8K0E8 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FgbQ8K0E8 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FgbQ8K0E8 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FgbQ8K0E8 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FgbQ8K0E8 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FgbQ8K0E8 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FgbQ8K0E8 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FgbQ8K0E8 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FgbQ8K0E8 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms