Protein–RNA interactions for Protein: Q8K039

Uncharacterized protein KIAA1143 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8K039 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q8K039 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q8K039 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q8K039 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q8K039 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q8K039 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q8K039 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q8K039 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q8K039 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q8K039 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q8K039 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q8K039 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q8K039 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q8K039 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q8K039 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q8K039 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q8K039 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q8K039 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q8K039 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q8K039 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q8K039 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q8K039 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q8K039 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q8K039 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q8K039 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q8K039 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q8K039 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q8K039 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q8K039 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q8K039 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q8K039 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q8K039 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q8K039 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q8K039 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q8K039 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q8K039 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q8K039 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q8K039 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q8K039 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q8K039 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q8K039 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q8K039 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q8K039 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q8K039 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q8K039 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q8K039 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q8K039 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q8K039 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q8K039 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q8K039 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q8K039 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q8K039 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q8K039 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Q8K039 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q8K039 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q8K039 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q8K039 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q8K039 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q8K039 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q8K039 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q8K039 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q8K039 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q8K039 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q8K039 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q8K039 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q8K039 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q8K039 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q8K039 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q8K039 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q8K039 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q8K039 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q8K039 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q8K039 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q8K039 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q8K039 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q8K039 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q8K039 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q8K039 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q8K039 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q8K039 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q8K039 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q8K039 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q8K039 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q8K039 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q8K039 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q8K039 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q8K039 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q8K039 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Q8K039 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Q8K039 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q8K039 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q8K039 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q8K039 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q8K039 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q8K039 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q8K039 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q8K039 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q8K039 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q8K039 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q8K039 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms