Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ78

Znf628, Zinc finger protein 628, mousemouse

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Length 1,038 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf628Q8CJ78 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Znf628Q8CJ78 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Znf628Q8CJ78 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Znf628Q8CJ78 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Znf628Q8CJ78 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Znf628Q8CJ78 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Znf628Q8CJ78 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Znf628Q8CJ78 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Znf628Q8CJ78 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Znf628Q8CJ78 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Znf628Q8CJ78 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Znf628Q8CJ78 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Znf628Q8CJ78 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Znf628Q8CJ78 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Znf628Q8CJ78 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Znf628Q8CJ78 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Znf628Q8CJ78 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Znf628Q8CJ78 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Znf628Q8CJ78 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Znf628Q8CJ78 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Znf628Q8CJ78 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Znf628Q8CJ78 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Znf628Q8CJ78 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Znf628Q8CJ78 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Znf628Q8CJ78 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Znf628Q8CJ78 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Znf628Q8CJ78 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Znf628Q8CJ78 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Znf628Q8CJ78 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Znf628Q8CJ78 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Znf628Q8CJ78 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Znf628Q8CJ78 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Znf628Q8CJ78 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Znf628Q8CJ78 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Znf628Q8CJ78 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Znf628Q8CJ78 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
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Znf628Q8CJ78 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Znf628Q8CJ78 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Znf628Q8CJ78 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Znf628Q8CJ78 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Znf628Q8CJ78 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Znf628Q8CJ78 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Znf628Q8CJ78 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Znf628Q8CJ78 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Znf628Q8CJ78 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Znf628Q8CJ78 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Znf628Q8CJ78 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Znf628Q8CJ78 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Znf628Q8CJ78 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Znf628Q8CJ78 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Znf628Q8CJ78 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Znf628Q8CJ78 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Znf628Q8CJ78 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Znf628Q8CJ78 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Znf628Q8CJ78 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Znf628Q8CJ78 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Znf628Q8CJ78 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Znf628Q8CJ78 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Znf628Q8CJ78 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Znf628Q8CJ78 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Znf628Q8CJ78 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Znf628Q8CJ78 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Znf628Q8CJ78 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Znf628Q8CJ78 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Znf628Q8CJ78 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Znf628Q8CJ78 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Znf628Q8CJ78 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Znf628Q8CJ78 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Znf628Q8CJ78 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Znf628Q8CJ78 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Znf628Q8CJ78 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Znf628Q8CJ78 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Znf628Q8CJ78 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Znf628Q8CJ78 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Znf628Q8CJ78 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Znf628Q8CJ78 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Znf628Q8CJ78 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Znf628Q8CJ78 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Znf628Q8CJ78 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Znf628Q8CJ78 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Znf628Q8CJ78 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Znf628Q8CJ78 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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