Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIX8

Lgsn, Lengsin, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LgsnQ8CIX8 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LgsnQ8CIX8 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LgsnQ8CIX8 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
LgsnQ8CIX8 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LgsnQ8CIX8 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LgsnQ8CIX8 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LgsnQ8CIX8 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LgsnQ8CIX8 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LgsnQ8CIX8 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LgsnQ8CIX8 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LgsnQ8CIX8 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LgsnQ8CIX8 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LgsnQ8CIX8 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LgsnQ8CIX8 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LgsnQ8CIX8 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LgsnQ8CIX8 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LgsnQ8CIX8 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LgsnQ8CIX8 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LgsnQ8CIX8 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LgsnQ8CIX8 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LgsnQ8CIX8 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LgsnQ8CIX8 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LgsnQ8CIX8 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LgsnQ8CIX8 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LgsnQ8CIX8 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LgsnQ8CIX8 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LgsnQ8CIX8 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LgsnQ8CIX8 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LgsnQ8CIX8 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LgsnQ8CIX8 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LgsnQ8CIX8 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LgsnQ8CIX8 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LgsnQ8CIX8 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LgsnQ8CIX8 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LgsnQ8CIX8 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LgsnQ8CIX8 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LgsnQ8CIX8 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LgsnQ8CIX8 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LgsnQ8CIX8 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LgsnQ8CIX8 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LgsnQ8CIX8 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LgsnQ8CIX8 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LgsnQ8CIX8 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LgsnQ8CIX8 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LgsnQ8CIX8 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LgsnQ8CIX8 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LgsnQ8CIX8 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LgsnQ8CIX8 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LgsnQ8CIX8 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LgsnQ8CIX8 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LgsnQ8CIX8 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LgsnQ8CIX8 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LgsnQ8CIX8 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LgsnQ8CIX8 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LgsnQ8CIX8 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LgsnQ8CIX8 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LgsnQ8CIX8 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LgsnQ8CIX8 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
LgsnQ8CIX8 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LgsnQ8CIX8 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
LgsnQ8CIX8 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LgsnQ8CIX8 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LgsnQ8CIX8 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LgsnQ8CIX8 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LgsnQ8CIX8 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LgsnQ8CIX8 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LgsnQ8CIX8 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LgsnQ8CIX8 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
LgsnQ8CIX8 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LgsnQ8CIX8 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LgsnQ8CIX8 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LgsnQ8CIX8 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LgsnQ8CIX8 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LgsnQ8CIX8 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LgsnQ8CIX8 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LgsnQ8CIX8 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LgsnQ8CIX8 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LgsnQ8CIX8 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LgsnQ8CIX8 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LgsnQ8CIX8 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LgsnQ8CIX8 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LgsnQ8CIX8 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LgsnQ8CIX8 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LgsnQ8CIX8 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LgsnQ8CIX8 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LgsnQ8CIX8 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LgsnQ8CIX8 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LgsnQ8CIX8 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LgsnQ8CIX8 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LgsnQ8CIX8 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LgsnQ8CIX8 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LgsnQ8CIX8 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LgsnQ8CIX8 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LgsnQ8CIX8 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LgsnQ8CIX8 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LgsnQ8CIX8 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LgsnQ8CIX8 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LgsnQ8CIX8 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LgsnQ8CIX8 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LgsnQ8CIX8 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms