Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIT9

Sbsn, Suprabasin, mousemouse

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbsnQ8CIT9 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SbsnQ8CIT9 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SbsnQ8CIT9 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SbsnQ8CIT9 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SbsnQ8CIT9 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SbsnQ8CIT9 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SbsnQ8CIT9 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SbsnQ8CIT9 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SbsnQ8CIT9 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SbsnQ8CIT9 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SbsnQ8CIT9 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SbsnQ8CIT9 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SbsnQ8CIT9 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SbsnQ8CIT9 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SbsnQ8CIT9 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SbsnQ8CIT9 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SbsnQ8CIT9 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SbsnQ8CIT9 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SbsnQ8CIT9 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SbsnQ8CIT9 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SbsnQ8CIT9 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SbsnQ8CIT9 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SbsnQ8CIT9 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SbsnQ8CIT9 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SbsnQ8CIT9 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SbsnQ8CIT9 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SbsnQ8CIT9 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
SbsnQ8CIT9 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SbsnQ8CIT9 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SbsnQ8CIT9 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SbsnQ8CIT9 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SbsnQ8CIT9 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SbsnQ8CIT9 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SbsnQ8CIT9 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SbsnQ8CIT9 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SbsnQ8CIT9 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SbsnQ8CIT9 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SbsnQ8CIT9 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SbsnQ8CIT9 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SbsnQ8CIT9 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SbsnQ8CIT9 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SbsnQ8CIT9 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SbsnQ8CIT9 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SbsnQ8CIT9 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SbsnQ8CIT9 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SbsnQ8CIT9 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SbsnQ8CIT9 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SbsnQ8CIT9 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SbsnQ8CIT9 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SbsnQ8CIT9 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SbsnQ8CIT9 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SbsnQ8CIT9 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SbsnQ8CIT9 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
SbsnQ8CIT9 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SbsnQ8CIT9 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SbsnQ8CIT9 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SbsnQ8CIT9 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SbsnQ8CIT9 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SbsnQ8CIT9 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SbsnQ8CIT9 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SbsnQ8CIT9 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SbsnQ8CIT9 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SbsnQ8CIT9 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SbsnQ8CIT9 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SbsnQ8CIT9 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SbsnQ8CIT9 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SbsnQ8CIT9 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.23
SbsnQ8CIT9 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.23
SbsnQ8CIT9 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SbsnQ8CIT9 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SbsnQ8CIT9 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SbsnQ8CIT9 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SbsnQ8CIT9 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SbsnQ8CIT9 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SbsnQ8CIT9 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SbsnQ8CIT9 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SbsnQ8CIT9 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SbsnQ8CIT9 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SbsnQ8CIT9 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SbsnQ8CIT9 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SbsnQ8CIT9 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SbsnQ8CIT9 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SbsnQ8CIT9 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SbsnQ8CIT9 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SbsnQ8CIT9 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SbsnQ8CIT9 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SbsnQ8CIT9 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SbsnQ8CIT9 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
SbsnQ8CIT9 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SbsnQ8CIT9 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SbsnQ8CIT9 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SbsnQ8CIT9 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SbsnQ8CIT9 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SbsnQ8CIT9 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SbsnQ8CIT9 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SbsnQ8CIT9 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SbsnQ8CIT9 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SbsnQ8CIT9 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SbsnQ8CIT9 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SbsnQ8CIT9 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms