Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIE6

Copa, Coatomer subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CopaQ8CIE6 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CopaQ8CIE6 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CopaQ8CIE6 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CopaQ8CIE6 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CopaQ8CIE6 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CopaQ8CIE6 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CopaQ8CIE6 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CopaQ8CIE6 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CopaQ8CIE6 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CopaQ8CIE6 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CopaQ8CIE6 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CopaQ8CIE6 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CopaQ8CIE6 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CopaQ8CIE6 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CopaQ8CIE6 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CopaQ8CIE6 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CopaQ8CIE6 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CopaQ8CIE6 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CopaQ8CIE6 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CopaQ8CIE6 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CopaQ8CIE6 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CopaQ8CIE6 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CopaQ8CIE6 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CopaQ8CIE6 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CopaQ8CIE6 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CopaQ8CIE6 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CopaQ8CIE6 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CopaQ8CIE6 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CopaQ8CIE6 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CopaQ8CIE6 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CopaQ8CIE6 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CopaQ8CIE6 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CopaQ8CIE6 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CopaQ8CIE6 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CopaQ8CIE6 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CopaQ8CIE6 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CopaQ8CIE6 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CopaQ8CIE6 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CopaQ8CIE6 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CopaQ8CIE6 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CopaQ8CIE6 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CopaQ8CIE6 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CopaQ8CIE6 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CopaQ8CIE6 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CopaQ8CIE6 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CopaQ8CIE6 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CopaQ8CIE6 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CopaQ8CIE6 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CopaQ8CIE6 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CopaQ8CIE6 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CopaQ8CIE6 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CopaQ8CIE6 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CopaQ8CIE6 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CopaQ8CIE6 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CopaQ8CIE6 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CopaQ8CIE6 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CopaQ8CIE6 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CopaQ8CIE6 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CopaQ8CIE6 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CopaQ8CIE6 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CopaQ8CIE6 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CopaQ8CIE6 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CopaQ8CIE6 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CopaQ8CIE6 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CopaQ8CIE6 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CopaQ8CIE6 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CopaQ8CIE6 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CopaQ8CIE6 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CopaQ8CIE6 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CopaQ8CIE6 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CopaQ8CIE6 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CopaQ8CIE6 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CopaQ8CIE6 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CopaQ8CIE6 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CopaQ8CIE6 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CopaQ8CIE6 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CopaQ8CIE6 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CopaQ8CIE6 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CopaQ8CIE6 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CopaQ8CIE6 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CopaQ8CIE6 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CopaQ8CIE6 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CopaQ8CIE6 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CopaQ8CIE6 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CopaQ8CIE6 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CopaQ8CIE6 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CopaQ8CIE6 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CopaQ8CIE6 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CopaQ8CIE6 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CopaQ8CIE6 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CopaQ8CIE6 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CopaQ8CIE6 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CopaQ8CIE6 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CopaQ8CIE6 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
CopaQ8CIE6 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CopaQ8CIE6 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CopaQ8CIE6 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CopaQ8CIE6 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CopaQ8CIE6 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CopaQ8CIE6 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms