Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGF7

Tcerg1, Transcription elongation regulator 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,100 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcerg1Q8CGF7 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tcerg1Q8CGF7 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tcerg1Q8CGF7 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tcerg1Q8CGF7 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tcerg1Q8CGF7 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tcerg1Q8CGF7 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tcerg1Q8CGF7 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tcerg1Q8CGF7 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tcerg1Q8CGF7 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tcerg1Q8CGF7 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tcerg1Q8CGF7 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tcerg1Q8CGF7 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tcerg1Q8CGF7 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tcerg1Q8CGF7 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tcerg1Q8CGF7 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tcerg1Q8CGF7 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tcerg1Q8CGF7 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tcerg1Q8CGF7 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tcerg1Q8CGF7 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tcerg1Q8CGF7 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tcerg1Q8CGF7 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Tcerg1Q8CGF7 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tcerg1Q8CGF7 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tcerg1Q8CGF7 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tcerg1Q8CGF7 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tcerg1Q8CGF7 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tcerg1Q8CGF7 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tcerg1Q8CGF7 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tcerg1Q8CGF7 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tcerg1Q8CGF7 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tcerg1Q8CGF7 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tcerg1Q8CGF7 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tcerg1Q8CGF7 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tcerg1Q8CGF7 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Tcerg1Q8CGF7 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tcerg1Q8CGF7 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tcerg1Q8CGF7 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tcerg1Q8CGF7 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tcerg1Q8CGF7 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tcerg1Q8CGF7 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tcerg1Q8CGF7 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tcerg1Q8CGF7 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tcerg1Q8CGF7 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tcerg1Q8CGF7 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tcerg1Q8CGF7 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tcerg1Q8CGF7 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tcerg1Q8CGF7 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tcerg1Q8CGF7 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tcerg1Q8CGF7 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tcerg1Q8CGF7 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tcerg1Q8CGF7 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tcerg1Q8CGF7 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tcerg1Q8CGF7 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tcerg1Q8CGF7 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tcerg1Q8CGF7 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tcerg1Q8CGF7 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tcerg1Q8CGF7 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tcerg1Q8CGF7 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tcerg1Q8CGF7 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tcerg1Q8CGF7 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tcerg1Q8CGF7 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tcerg1Q8CGF7 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tcerg1Q8CGF7 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tcerg1Q8CGF7 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tcerg1Q8CGF7 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tcerg1Q8CGF7 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tcerg1Q8CGF7 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tcerg1Q8CGF7 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tcerg1Q8CGF7 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Tcerg1Q8CGF7 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tcerg1Q8CGF7 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tcerg1Q8CGF7 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Tcerg1Q8CGF7 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tcerg1Q8CGF7 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tcerg1Q8CGF7 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tcerg1Q8CGF7 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tcerg1Q8CGF7 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tcerg1Q8CGF7 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tcerg1Q8CGF7 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tcerg1Q8CGF7 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tcerg1Q8CGF7 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tcerg1Q8CGF7 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tcerg1Q8CGF7 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tcerg1Q8CGF7 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tcerg1Q8CGF7 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tcerg1Q8CGF7 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tcerg1Q8CGF7 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tcerg1Q8CGF7 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tcerg1Q8CGF7 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tcerg1Q8CGF7 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tcerg1Q8CGF7 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tcerg1Q8CGF7 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tcerg1Q8CGF7 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tcerg1Q8CGF7 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tcerg1Q8CGF7 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tcerg1Q8CGF7 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tcerg1Q8CGF7 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tcerg1Q8CGF7 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tcerg1Q8CGF7 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tcerg1Q8CGF7 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
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