Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE13

Ccdc17, Coiled-coil domain-containing protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc17Q8CE13 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc17Q8CE13 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc17Q8CE13 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Ccdc17Q8CE13 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Ccdc17Q8CE13 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc17Q8CE13 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc17Q8CE13 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc17Q8CE13 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc17Q8CE13 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc17Q8CE13 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc17Q8CE13 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc17Q8CE13 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc17Q8CE13 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc17Q8CE13 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc17Q8CE13 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc17Q8CE13 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc17Q8CE13 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc17Q8CE13 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc17Q8CE13 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc17Q8CE13 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc17Q8CE13 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc17Q8CE13 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc17Q8CE13 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc17Q8CE13 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc17Q8CE13 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc17Q8CE13 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc17Q8CE13 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc17Q8CE13 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc17Q8CE13 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc17Q8CE13 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc17Q8CE13 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc17Q8CE13 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc17Q8CE13 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc17Q8CE13 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc17Q8CE13 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc17Q8CE13 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc17Q8CE13 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc17Q8CE13 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc17Q8CE13 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc17Q8CE13 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc17Q8CE13 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc17Q8CE13 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc17Q8CE13 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc17Q8CE13 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc17Q8CE13 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc17Q8CE13 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc17Q8CE13 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc17Q8CE13 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc17Q8CE13 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc17Q8CE13 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc17Q8CE13 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc17Q8CE13 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc17Q8CE13 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc17Q8CE13 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc17Q8CE13 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc17Q8CE13 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc17Q8CE13 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc17Q8CE13 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc17Q8CE13 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc17Q8CE13 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc17Q8CE13 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc17Q8CE13 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc17Q8CE13 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc17Q8CE13 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc17Q8CE13 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc17Q8CE13 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc17Q8CE13 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc17Q8CE13 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc17Q8CE13 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc17Q8CE13 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc17Q8CE13 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc17Q8CE13 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc17Q8CE13 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc17Q8CE13 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc17Q8CE13 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc17Q8CE13 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc17Q8CE13 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc17Q8CE13 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc17Q8CE13 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc17Q8CE13 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc17Q8CE13 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc17Q8CE13 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc17Q8CE13 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc17Q8CE13 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc17Q8CE13 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc17Q8CE13 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc17Q8CE13 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc17Q8CE13 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc17Q8CE13 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc17Q8CE13 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc17Q8CE13 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc17Q8CE13 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc17Q8CE13 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc17Q8CE13 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc17Q8CE13 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc17Q8CE13 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc17Q8CE13 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc17Q8CE13 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc17Q8CE13 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc17Q8CE13 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms