Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDL9

Ccdc87, Coiled-coil domain-containing protein 87, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc87Q8CDL9 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc87Q8CDL9 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc87Q8CDL9 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc87Q8CDL9 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc87Q8CDL9 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc87Q8CDL9 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc87Q8CDL9 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc87Q8CDL9 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc87Q8CDL9 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc87Q8CDL9 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc87Q8CDL9 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc87Q8CDL9 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc87Q8CDL9 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc87Q8CDL9 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc87Q8CDL9 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc87Q8CDL9 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc87Q8CDL9 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc87Q8CDL9 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc87Q8CDL9 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc87Q8CDL9 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc87Q8CDL9 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc87Q8CDL9 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc87Q8CDL9 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc87Q8CDL9 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc87Q8CDL9 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc87Q8CDL9 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc87Q8CDL9 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc87Q8CDL9 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc87Q8CDL9 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc87Q8CDL9 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc87Q8CDL9 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc87Q8CDL9 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc87Q8CDL9 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc87Q8CDL9 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc87Q8CDL9 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc87Q8CDL9 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc87Q8CDL9 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc87Q8CDL9 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc87Q8CDL9 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc87Q8CDL9 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc87Q8CDL9 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc87Q8CDL9 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc87Q8CDL9 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc87Q8CDL9 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc87Q8CDL9 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc87Q8CDL9 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc87Q8CDL9 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc87Q8CDL9 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc87Q8CDL9 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc87Q8CDL9 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc87Q8CDL9 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc87Q8CDL9 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc87Q8CDL9 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc87Q8CDL9 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc87Q8CDL9 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc87Q8CDL9 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc87Q8CDL9 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc87Q8CDL9 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc87Q8CDL9 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc87Q8CDL9 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc87Q8CDL9 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc87Q8CDL9 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc87Q8CDL9 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc87Q8CDL9 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc87Q8CDL9 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc87Q8CDL9 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc87Q8CDL9 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc87Q8CDL9 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc87Q8CDL9 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc87Q8CDL9 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc87Q8CDL9 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc87Q8CDL9 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc87Q8CDL9 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc87Q8CDL9 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc87Q8CDL9 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc87Q8CDL9 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc87Q8CDL9 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc87Q8CDL9 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc87Q8CDL9 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc87Q8CDL9 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc87Q8CDL9 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc87Q8CDL9 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc87Q8CDL9 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc87Q8CDL9 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc87Q8CDL9 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc87Q8CDL9 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc87Q8CDL9 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc87Q8CDL9 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc87Q8CDL9 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc87Q8CDL9 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc87Q8CDL9 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc87Q8CDL9 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc87Q8CDL9 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc87Q8CDL9 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc87Q8CDL9 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc87Q8CDL9 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc87Q8CDL9 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc87Q8CDL9 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc87Q8CDL9 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc87Q8CDL9 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms