Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCI5

Rybp, RING1 and YY1-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RybpQ8CCI5 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RybpQ8CCI5 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RybpQ8CCI5 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RybpQ8CCI5 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RybpQ8CCI5 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RybpQ8CCI5 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RybpQ8CCI5 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RybpQ8CCI5 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RybpQ8CCI5 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RybpQ8CCI5 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RybpQ8CCI5 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RybpQ8CCI5 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RybpQ8CCI5 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RybpQ8CCI5 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RybpQ8CCI5 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RybpQ8CCI5 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RybpQ8CCI5 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RybpQ8CCI5 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RybpQ8CCI5 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RybpQ8CCI5 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RybpQ8CCI5 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RybpQ8CCI5 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RybpQ8CCI5 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RybpQ8CCI5 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RybpQ8CCI5 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RybpQ8CCI5 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RybpQ8CCI5 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RybpQ8CCI5 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RybpQ8CCI5 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RybpQ8CCI5 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RybpQ8CCI5 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RybpQ8CCI5 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RybpQ8CCI5 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RybpQ8CCI5 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RybpQ8CCI5 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RybpQ8CCI5 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RybpQ8CCI5 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RybpQ8CCI5 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RybpQ8CCI5 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RybpQ8CCI5 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RybpQ8CCI5 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RybpQ8CCI5 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RybpQ8CCI5 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RybpQ8CCI5 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RybpQ8CCI5 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RybpQ8CCI5 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RybpQ8CCI5 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RybpQ8CCI5 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RybpQ8CCI5 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RybpQ8CCI5 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RybpQ8CCI5 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RybpQ8CCI5 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RybpQ8CCI5 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RybpQ8CCI5 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RybpQ8CCI5 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RybpQ8CCI5 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RybpQ8CCI5 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RybpQ8CCI5 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RybpQ8CCI5 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RybpQ8CCI5 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RybpQ8CCI5 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RybpQ8CCI5 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RybpQ8CCI5 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RybpQ8CCI5 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RybpQ8CCI5 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
RybpQ8CCI5 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RybpQ8CCI5 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RybpQ8CCI5 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
RybpQ8CCI5 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RybpQ8CCI5 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RybpQ8CCI5 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RybpQ8CCI5 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RybpQ8CCI5 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RybpQ8CCI5 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RybpQ8CCI5 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RybpQ8CCI5 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RybpQ8CCI5 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RybpQ8CCI5 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RybpQ8CCI5 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RybpQ8CCI5 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
RybpQ8CCI5 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RybpQ8CCI5 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
RybpQ8CCI5 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
RybpQ8CCI5 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RybpQ8CCI5 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
RybpQ8CCI5 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RybpQ8CCI5 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RybpQ8CCI5 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RybpQ8CCI5 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RybpQ8CCI5 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RybpQ8CCI5 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
RybpQ8CCI5 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RybpQ8CCI5 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RybpQ8CCI5 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RybpQ8CCI5 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RybpQ8CCI5 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RybpQ8CCI5 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RybpQ8CCI5 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RybpQ8CCI5 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RybpQ8CCI5 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms