Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBY1

Samd4a, Protein Smaug homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd4aQ8CBY1 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Samd4aQ8CBY1 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Samd4aQ8CBY1 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Samd4aQ8CBY1 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Samd4aQ8CBY1 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Samd4aQ8CBY1 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Samd4aQ8CBY1 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Samd4aQ8CBY1 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Samd4aQ8CBY1 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Samd4aQ8CBY1 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Samd4aQ8CBY1 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Samd4aQ8CBY1 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Samd4aQ8CBY1 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Samd4aQ8CBY1 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Samd4aQ8CBY1 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Samd4aQ8CBY1 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Samd4aQ8CBY1 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Samd4aQ8CBY1 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Samd4aQ8CBY1 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Samd4aQ8CBY1 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Samd4aQ8CBY1 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Samd4aQ8CBY1 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Samd4aQ8CBY1 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Samd4aQ8CBY1 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Samd4aQ8CBY1 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Samd4aQ8CBY1 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Samd4aQ8CBY1 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Samd4aQ8CBY1 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Samd4aQ8CBY1 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Samd4aQ8CBY1 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Samd4aQ8CBY1 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Samd4aQ8CBY1 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Samd4aQ8CBY1 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Samd4aQ8CBY1 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Samd4aQ8CBY1 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Samd4aQ8CBY1 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Samd4aQ8CBY1 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Samd4aQ8CBY1 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Samd4aQ8CBY1 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Samd4aQ8CBY1 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Samd4aQ8CBY1 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Samd4aQ8CBY1 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Samd4aQ8CBY1 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Samd4aQ8CBY1 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Samd4aQ8CBY1 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Samd4aQ8CBY1 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Samd4aQ8CBY1 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Samd4aQ8CBY1 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Samd4aQ8CBY1 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Samd4aQ8CBY1 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Samd4aQ8CBY1 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Samd4aQ8CBY1 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Samd4aQ8CBY1 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Samd4aQ8CBY1 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Samd4aQ8CBY1 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Samd4aQ8CBY1 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Samd4aQ8CBY1 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Samd4aQ8CBY1 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Samd4aQ8CBY1 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Samd4aQ8CBY1 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Samd4aQ8CBY1 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Samd4aQ8CBY1 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Samd4aQ8CBY1 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Samd4aQ8CBY1 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Samd4aQ8CBY1 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Samd4aQ8CBY1 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Samd4aQ8CBY1 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Samd4aQ8CBY1 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Samd4aQ8CBY1 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Samd4aQ8CBY1 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Samd4aQ8CBY1 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Samd4aQ8CBY1 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Samd4aQ8CBY1 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Samd4aQ8CBY1 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Samd4aQ8CBY1 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Samd4aQ8CBY1 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Samd4aQ8CBY1 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Samd4aQ8CBY1 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Samd4aQ8CBY1 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Samd4aQ8CBY1 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Samd4aQ8CBY1 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Samd4aQ8CBY1 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Samd4aQ8CBY1 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Samd4aQ8CBY1 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Samd4aQ8CBY1 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Samd4aQ8CBY1 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Samd4aQ8CBY1 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Samd4aQ8CBY1 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Samd4aQ8CBY1 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Samd4aQ8CBY1 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Samd4aQ8CBY1 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Samd4aQ8CBY1 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Samd4aQ8CBY1 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Samd4aQ8CBY1 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Samd4aQ8CBY1 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Samd4aQ8CBY1 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Samd4aQ8CBY1 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Samd4aQ8CBY1 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Samd4aQ8CBY1 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Samd4aQ8CBY1 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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