Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBC6

Lrrn3, Leucine-rich repeat neuronal protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrn3Q8CBC6 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lrrn3Q8CBC6 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lrrn3Q8CBC6 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lrrn3Q8CBC6 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lrrn3Q8CBC6 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lrrn3Q8CBC6 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lrrn3Q8CBC6 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lrrn3Q8CBC6 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lrrn3Q8CBC6 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lrrn3Q8CBC6 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lrrn3Q8CBC6 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lrrn3Q8CBC6 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lrrn3Q8CBC6 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lrrn3Q8CBC6 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lrrn3Q8CBC6 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Lrrn3Q8CBC6 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lrrn3Q8CBC6 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lrrn3Q8CBC6 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lrrn3Q8CBC6 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lrrn3Q8CBC6 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lrrn3Q8CBC6 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lrrn3Q8CBC6 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lrrn3Q8CBC6 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lrrn3Q8CBC6 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Lrrn3Q8CBC6 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lrrn3Q8CBC6 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lrrn3Q8CBC6 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lrrn3Q8CBC6 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lrrn3Q8CBC6 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lrrn3Q8CBC6 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lrrn3Q8CBC6 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lrrn3Q8CBC6 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lrrn3Q8CBC6 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lrrn3Q8CBC6 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lrrn3Q8CBC6 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lrrn3Q8CBC6 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lrrn3Q8CBC6 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lrrn3Q8CBC6 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lrrn3Q8CBC6 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Lrrn3Q8CBC6 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Lrrn3Q8CBC6 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lrrn3Q8CBC6 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lrrn3Q8CBC6 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lrrn3Q8CBC6 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lrrn3Q8CBC6 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lrrn3Q8CBC6 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lrrn3Q8CBC6 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lrrn3Q8CBC6 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lrrn3Q8CBC6 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lrrn3Q8CBC6 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Lrrn3Q8CBC6 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Lrrn3Q8CBC6 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Lrrn3Q8CBC6 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Lrrn3Q8CBC6 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Lrrn3Q8CBC6 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Lrrn3Q8CBC6 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrrn3Q8CBC6 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Lrrn3Q8CBC6 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Lrrn3Q8CBC6 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrrn3Q8CBC6 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrrn3Q8CBC6 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrrn3Q8CBC6 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrrn3Q8CBC6 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrrn3Q8CBC6 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrrn3Q8CBC6 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrrn3Q8CBC6 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrrn3Q8CBC6 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrrn3Q8CBC6 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrrn3Q8CBC6 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrrn3Q8CBC6 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrrn3Q8CBC6 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrrn3Q8CBC6 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrrn3Q8CBC6 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrrn3Q8CBC6 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrrn3Q8CBC6 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lrrn3Q8CBC6 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lrrn3Q8CBC6 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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