Protein–RNA interactions for Protein: Q8CB27

Yod1, Ubiquitin thioesterase OTU1, mousemouse

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Length 343 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Yod1Q8CB27 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Yod1Q8CB27 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Yod1Q8CB27 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Yod1Q8CB27 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Yod1Q8CB27 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Yod1Q8CB27 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Yod1Q8CB27 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Yod1Q8CB27 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Yod1Q8CB27 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Yod1Q8CB27 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Yod1Q8CB27 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Yod1Q8CB27 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Yod1Q8CB27 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Yod1Q8CB27 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Yod1Q8CB27 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Yod1Q8CB27 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Yod1Q8CB27 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Yod1Q8CB27 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Yod1Q8CB27 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Yod1Q8CB27 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Yod1Q8CB27 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Yod1Q8CB27 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Yod1Q8CB27 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Yod1Q8CB27 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Yod1Q8CB27 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Yod1Q8CB27 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Yod1Q8CB27 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Yod1Q8CB27 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Yod1Q8CB27 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Yod1Q8CB27 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Yod1Q8CB27 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Yod1Q8CB27 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Yod1Q8CB27 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Yod1Q8CB27 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Yod1Q8CB27 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Yod1Q8CB27 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Yod1Q8CB27 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Yod1Q8CB27 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Yod1Q8CB27 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Yod1Q8CB27 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Yod1Q8CB27 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Yod1Q8CB27 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Yod1Q8CB27 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Yod1Q8CB27 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Yod1Q8CB27 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Yod1Q8CB27 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Yod1Q8CB27 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Yod1Q8CB27 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Yod1Q8CB27 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Yod1Q8CB27 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Yod1Q8CB27 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Yod1Q8CB27 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Yod1Q8CB27 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Yod1Q8CB27 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Yod1Q8CB27 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Yod1Q8CB27 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Yod1Q8CB27 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Yod1Q8CB27 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Yod1Q8CB27 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Yod1Q8CB27 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Yod1Q8CB27 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Yod1Q8CB27 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Yod1Q8CB27 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Yod1Q8CB27 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Yod1Q8CB27 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Yod1Q8CB27 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Yod1Q8CB27 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Yod1Q8CB27 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Yod1Q8CB27 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Yod1Q8CB27 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Yod1Q8CB27 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Yod1Q8CB27 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Yod1Q8CB27 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Yod1Q8CB27 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Yod1Q8CB27 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Yod1Q8CB27 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Yod1Q8CB27 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Yod1Q8CB27 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Yod1Q8CB27 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Yod1Q8CB27 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Yod1Q8CB27 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Yod1Q8CB27 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Yod1Q8CB27 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Yod1Q8CB27 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Yod1Q8CB27 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Yod1Q8CB27 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Yod1Q8CB27 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Yod1Q8CB27 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Yod1Q8CB27 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Yod1Q8CB27 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Yod1Q8CB27 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Yod1Q8CB27 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Yod1Q8CB27 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Yod1Q8CB27 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Yod1Q8CB27 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Yod1Q8CB27 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Yod1Q8CB27 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Yod1Q8CB27 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Yod1Q8CB27 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Yod1Q8CB27 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms