Protein–RNA interactions for Protein: Q8CAT8

Fbxo48, F-box only protein 48, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo48Q8CAT8 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fbxo48Q8CAT8 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fbxo48Q8CAT8 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fbxo48Q8CAT8 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fbxo48Q8CAT8 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fbxo48Q8CAT8 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fbxo48Q8CAT8 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fbxo48Q8CAT8 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fbxo48Q8CAT8 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fbxo48Q8CAT8 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fbxo48Q8CAT8 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fbxo48Q8CAT8 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fbxo48Q8CAT8 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fbxo48Q8CAT8 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fbxo48Q8CAT8 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fbxo48Q8CAT8 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fbxo48Q8CAT8 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fbxo48Q8CAT8 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fbxo48Q8CAT8 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fbxo48Q8CAT8 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fbxo48Q8CAT8 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fbxo48Q8CAT8 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fbxo48Q8CAT8 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fbxo48Q8CAT8 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fbxo48Q8CAT8 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fbxo48Q8CAT8 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fbxo48Q8CAT8 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fbxo48Q8CAT8 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fbxo48Q8CAT8 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Fbxo48Q8CAT8 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fbxo48Q8CAT8 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fbxo48Q8CAT8 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Fbxo48Q8CAT8 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fbxo48Q8CAT8 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fbxo48Q8CAT8 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fbxo48Q8CAT8 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fbxo48Q8CAT8 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fbxo48Q8CAT8 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fbxo48Q8CAT8 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fbxo48Q8CAT8 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fbxo48Q8CAT8 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fbxo48Q8CAT8 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fbxo48Q8CAT8 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fbxo48Q8CAT8 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fbxo48Q8CAT8 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fbxo48Q8CAT8 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fbxo48Q8CAT8 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fbxo48Q8CAT8 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fbxo48Q8CAT8 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fbxo48Q8CAT8 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fbxo48Q8CAT8 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Fbxo48Q8CAT8 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fbxo48Q8CAT8 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Fbxo48Q8CAT8 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fbxo48Q8CAT8 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fbxo48Q8CAT8 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Fbxo48Q8CAT8 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Fbxo48Q8CAT8 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fbxo48Q8CAT8 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fbxo48Q8CAT8 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fbxo48Q8CAT8 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fbxo48Q8CAT8 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fbxo48Q8CAT8 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fbxo48Q8CAT8 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fbxo48Q8CAT8 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fbxo48Q8CAT8 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Fbxo48Q8CAT8 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Fbxo48Q8CAT8 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fbxo48Q8CAT8 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Fbxo48Q8CAT8 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Fbxo48Q8CAT8 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fbxo48Q8CAT8 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Fbxo48Q8CAT8 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fbxo48Q8CAT8 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fbxo48Q8CAT8 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fbxo48Q8CAT8 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fbxo48Q8CAT8 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fbxo48Q8CAT8 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Fbxo48Q8CAT8 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fbxo48Q8CAT8 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fbxo48Q8CAT8 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fbxo48Q8CAT8 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fbxo48Q8CAT8 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fbxo48Q8CAT8 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fbxo48Q8CAT8 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fbxo48Q8CAT8 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fbxo48Q8CAT8 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fbxo48Q8CAT8 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fbxo48Q8CAT8 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fbxo48Q8CAT8 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fbxo48Q8CAT8 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fbxo48Q8CAT8 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fbxo48Q8CAT8 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Fbxo48Q8CAT8 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Fbxo48Q8CAT8 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fbxo48Q8CAT8 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.4 ms