Protein–RNA interactions for Protein: Q8C966

Phf21b, PHD finger protein 21B, mousemouse

Predictions only

Length 487 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf21bQ8C966 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Phf21bQ8C966 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Phf21bQ8C966 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Phf21bQ8C966 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Phf21bQ8C966 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Phf21bQ8C966 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Phf21bQ8C966 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Phf21bQ8C966 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Phf21bQ8C966 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Phf21bQ8C966 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Phf21bQ8C966 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Phf21bQ8C966 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Phf21bQ8C966 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Phf21bQ8C966 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Phf21bQ8C966 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Phf21bQ8C966 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Phf21bQ8C966 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Phf21bQ8C966 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Phf21bQ8C966 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Phf21bQ8C966 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Phf21bQ8C966 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Phf21bQ8C966 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Phf21bQ8C966 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Phf21bQ8C966 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Phf21bQ8C966 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Phf21bQ8C966 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Phf21bQ8C966 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Phf21bQ8C966 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Phf21bQ8C966 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Phf21bQ8C966 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Phf21bQ8C966 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Phf21bQ8C966 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Phf21bQ8C966 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Phf21bQ8C966 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Phf21bQ8C966 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Phf21bQ8C966 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Phf21bQ8C966 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Phf21bQ8C966 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Phf21bQ8C966 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Phf21bQ8C966 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Phf21bQ8C966 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Phf21bQ8C966 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Phf21bQ8C966 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Phf21bQ8C966 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Phf21bQ8C966 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Phf21bQ8C966 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Phf21bQ8C966 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Phf21bQ8C966 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Phf21bQ8C966 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Phf21bQ8C966 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Phf21bQ8C966 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Phf21bQ8C966 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Phf21bQ8C966 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Phf21bQ8C966 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Phf21bQ8C966 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Phf21bQ8C966 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Phf21bQ8C966 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Phf21bQ8C966 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Phf21bQ8C966 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Phf21bQ8C966 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Phf21bQ8C966 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Phf21bQ8C966 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Phf21bQ8C966 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Phf21bQ8C966 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Phf21bQ8C966 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Phf21bQ8C966 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Phf21bQ8C966 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Phf21bQ8C966 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Phf21bQ8C966 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Phf21bQ8C966 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Phf21bQ8C966 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Phf21bQ8C966 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Phf21bQ8C966 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Phf21bQ8C966 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Phf21bQ8C966 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Phf21bQ8C966 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Phf21bQ8C966 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Phf21bQ8C966 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Phf21bQ8C966 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Phf21bQ8C966 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Phf21bQ8C966 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Phf21bQ8C966 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Phf21bQ8C966 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Phf21bQ8C966 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Phf21bQ8C966 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Phf21bQ8C966 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Phf21bQ8C966 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Phf21bQ8C966 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Phf21bQ8C966 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Phf21bQ8C966 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Phf21bQ8C966 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Phf21bQ8C966 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Phf21bQ8C966 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Phf21bQ8C966 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Phf21bQ8C966 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Phf21bQ8C966 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Phf21bQ8C966 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Phf21bQ8C966 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Phf21bQ8C966 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Phf21bQ8C966 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms