Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5T8

Ccdc113, Coiled-coil domain-containing protein 113, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc113Q8C5T8 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
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Ccdc113Q8C5T8 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc113Q8C5T8 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc113Q8C5T8 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc113Q8C5T8 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc113Q8C5T8 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc113Q8C5T8 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
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Ccdc113Q8C5T8 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc113Q8C5T8 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc113Q8C5T8 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc113Q8C5T8 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
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Ccdc113Q8C5T8 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
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Ccdc113Q8C5T8 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
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Ccdc113Q8C5T8 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
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Ccdc113Q8C5T8 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc113Q8C5T8 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
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Ccdc113Q8C5T8 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
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Ccdc113Q8C5T8 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
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Ccdc113Q8C5T8 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
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Ccdc113Q8C5T8 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc113Q8C5T8 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
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Ccdc113Q8C5T8 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc113Q8C5T8 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
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Ccdc113Q8C5T8 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc113Q8C5T8 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc113Q8C5T8 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc113Q8C5T8 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc113Q8C5T8 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc113Q8C5T8 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc113Q8C5T8 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc113Q8C5T8 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc113Q8C5T8 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc113Q8C5T8 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
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Ccdc113Q8C5T8 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc113Q8C5T8 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
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