Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5L3

Cnot2, CCR4-NOT transcription complex subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot2Q8C5L3 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cnot2Q8C5L3 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cnot2Q8C5L3 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cnot2Q8C5L3 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cnot2Q8C5L3 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cnot2Q8C5L3 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Cnot2Q8C5L3 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cnot2Q8C5L3 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cnot2Q8C5L3 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cnot2Q8C5L3 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cnot2Q8C5L3 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cnot2Q8C5L3 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cnot2Q8C5L3 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cnot2Q8C5L3 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cnot2Q8C5L3 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Cnot2Q8C5L3 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cnot2Q8C5L3 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cnot2Q8C5L3 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cnot2Q8C5L3 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Cnot2Q8C5L3 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cnot2Q8C5L3 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cnot2Q8C5L3 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cnot2Q8C5L3 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cnot2Q8C5L3 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cnot2Q8C5L3 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cnot2Q8C5L3 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cnot2Q8C5L3 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnot2Q8C5L3 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnot2Q8C5L3 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnot2Q8C5L3 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnot2Q8C5L3 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnot2Q8C5L3 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnot2Q8C5L3 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnot2Q8C5L3 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnot2Q8C5L3 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnot2Q8C5L3 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnot2Q8C5L3 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnot2Q8C5L3 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnot2Q8C5L3 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnot2Q8C5L3 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnot2Q8C5L3 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnot2Q8C5L3 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnot2Q8C5L3 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnot2Q8C5L3 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnot2Q8C5L3 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnot2Q8C5L3 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnot2Q8C5L3 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnot2Q8C5L3 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnot2Q8C5L3 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnot2Q8C5L3 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cnot2Q8C5L3 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cnot2Q8C5L3 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cnot2Q8C5L3 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cnot2Q8C5L3 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cnot2Q8C5L3 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cnot2Q8C5L3 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cnot2Q8C5L3 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cnot2Q8C5L3 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cnot2Q8C5L3 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cnot2Q8C5L3 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cnot2Q8C5L3 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cnot2Q8C5L3 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cnot2Q8C5L3 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cnot2Q8C5L3 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cnot2Q8C5L3 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cnot2Q8C5L3 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cnot2Q8C5L3 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cnot2Q8C5L3 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cnot2Q8C5L3 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cnot2Q8C5L3 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cnot2Q8C5L3 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cnot2Q8C5L3 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cnot2Q8C5L3 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cnot2Q8C5L3 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cnot2Q8C5L3 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cnot2Q8C5L3 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cnot2Q8C5L3 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cnot2Q8C5L3 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cnot2Q8C5L3 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cnot2Q8C5L3 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cnot2Q8C5L3 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cnot2Q8C5L3 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cnot2Q8C5L3 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cnot2Q8C5L3 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cnot2Q8C5L3 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cnot2Q8C5L3 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cnot2Q8C5L3 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cnot2Q8C5L3 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cnot2Q8C5L3 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cnot2Q8C5L3 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cnot2Q8C5L3 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cnot2Q8C5L3 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Cnot2Q8C5L3 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cnot2Q8C5L3 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cnot2Q8C5L3 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cnot2Q8C5L3 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cnot2Q8C5L3 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cnot2Q8C5L3 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Cnot2Q8C5L3 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cnot2Q8C5L3 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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