Protein–RNA interactions for Protein: Q8C4D8

Gm11541, Predicted gene 11541, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm11541Q8C4D8 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm11541Q8C4D8 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm11541Q8C4D8 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm11541Q8C4D8 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm11541Q8C4D8 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm11541Q8C4D8 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm11541Q8C4D8 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm11541Q8C4D8 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm11541Q8C4D8 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm11541Q8C4D8 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm11541Q8C4D8 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm11541Q8C4D8 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm11541Q8C4D8 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm11541Q8C4D8 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm11541Q8C4D8 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm11541Q8C4D8 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm11541Q8C4D8 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm11541Q8C4D8 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm11541Q8C4D8 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm11541Q8C4D8 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm11541Q8C4D8 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm11541Q8C4D8 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm11541Q8C4D8 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm11541Q8C4D8 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm11541Q8C4D8 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm11541Q8C4D8 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm11541Q8C4D8 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm11541Q8C4D8 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm11541Q8C4D8 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm11541Q8C4D8 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm11541Q8C4D8 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm11541Q8C4D8 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm11541Q8C4D8 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm11541Q8C4D8 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm11541Q8C4D8 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm11541Q8C4D8 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm11541Q8C4D8 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm11541Q8C4D8 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm11541Q8C4D8 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm11541Q8C4D8 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm11541Q8C4D8 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm11541Q8C4D8 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm11541Q8C4D8 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm11541Q8C4D8 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm11541Q8C4D8 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm11541Q8C4D8 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm11541Q8C4D8 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm11541Q8C4D8 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm11541Q8C4D8 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm11541Q8C4D8 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm11541Q8C4D8 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm11541Q8C4D8 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm11541Q8C4D8 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm11541Q8C4D8 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm11541Q8C4D8 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm11541Q8C4D8 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm11541Q8C4D8 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm11541Q8C4D8 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm11541Q8C4D8 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm11541Q8C4D8 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm11541Q8C4D8 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm11541Q8C4D8 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm11541Q8C4D8 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm11541Q8C4D8 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm11541Q8C4D8 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm11541Q8C4D8 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm11541Q8C4D8 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm11541Q8C4D8 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm11541Q8C4D8 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm11541Q8C4D8 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm11541Q8C4D8 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm11541Q8C4D8 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm11541Q8C4D8 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm11541Q8C4D8 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm11541Q8C4D8 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm11541Q8C4D8 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm11541Q8C4D8 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm11541Q8C4D8 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm11541Q8C4D8 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm11541Q8C4D8 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm11541Q8C4D8 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm11541Q8C4D8 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm11541Q8C4D8 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm11541Q8C4D8 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm11541Q8C4D8 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm11541Q8C4D8 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm11541Q8C4D8 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm11541Q8C4D8 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm11541Q8C4D8 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm11541Q8C4D8 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm11541Q8C4D8 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm11541Q8C4D8 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm11541Q8C4D8 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm11541Q8C4D8 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm11541Q8C4D8 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm11541Q8C4D8 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm11541Q8C4D8 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm11541Q8C4D8 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm11541Q8C4D8 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm11541Q8C4D8 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms