Protein–RNA interactions for Protein: Q8C2S7

Amigo3, Amphoterin-induced protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amigo3Q8C2S7 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Amigo3Q8C2S7 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Amigo3Q8C2S7 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Amigo3Q8C2S7 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Amigo3Q8C2S7 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Amigo3Q8C2S7 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Amigo3Q8C2S7 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Amigo3Q8C2S7 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Amigo3Q8C2S7 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Amigo3Q8C2S7 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Amigo3Q8C2S7 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Amigo3Q8C2S7 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Amigo3Q8C2S7 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Amigo3Q8C2S7 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Amigo3Q8C2S7 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Amigo3Q8C2S7 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Amigo3Q8C2S7 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Amigo3Q8C2S7 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Amigo3Q8C2S7 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Amigo3Q8C2S7 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Amigo3Q8C2S7 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Amigo3Q8C2S7 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Amigo3Q8C2S7 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Amigo3Q8C2S7 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Amigo3Q8C2S7 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Amigo3Q8C2S7 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Amigo3Q8C2S7 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Amigo3Q8C2S7 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Amigo3Q8C2S7 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Amigo3Q8C2S7 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Amigo3Q8C2S7 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Amigo3Q8C2S7 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Amigo3Q8C2S7 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Amigo3Q8C2S7 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Amigo3Q8C2S7 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Amigo3Q8C2S7 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Amigo3Q8C2S7 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Amigo3Q8C2S7 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Amigo3Q8C2S7 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Amigo3Q8C2S7 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Amigo3Q8C2S7 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Amigo3Q8C2S7 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Amigo3Q8C2S7 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Amigo3Q8C2S7 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Amigo3Q8C2S7 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Amigo3Q8C2S7 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Amigo3Q8C2S7 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Amigo3Q8C2S7 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Amigo3Q8C2S7 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Amigo3Q8C2S7 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Amigo3Q8C2S7 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Amigo3Q8C2S7 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Amigo3Q8C2S7 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Amigo3Q8C2S7 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Amigo3Q8C2S7 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Amigo3Q8C2S7 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Amigo3Q8C2S7 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Amigo3Q8C2S7 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Amigo3Q8C2S7 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Amigo3Q8C2S7 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Amigo3Q8C2S7 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Amigo3Q8C2S7 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Amigo3Q8C2S7 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Amigo3Q8C2S7 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Amigo3Q8C2S7 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Amigo3Q8C2S7 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Amigo3Q8C2S7 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Amigo3Q8C2S7 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Amigo3Q8C2S7 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Amigo3Q8C2S7 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Amigo3Q8C2S7 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Amigo3Q8C2S7 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Amigo3Q8C2S7 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Amigo3Q8C2S7 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Amigo3Q8C2S7 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Amigo3Q8C2S7 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Amigo3Q8C2S7 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Amigo3Q8C2S7 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Amigo3Q8C2S7 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Amigo3Q8C2S7 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Amigo3Q8C2S7 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Amigo3Q8C2S7 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Amigo3Q8C2S7 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Amigo3Q8C2S7 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Amigo3Q8C2S7 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Amigo3Q8C2S7 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Amigo3Q8C2S7 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Amigo3Q8C2S7 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Amigo3Q8C2S7 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Amigo3Q8C2S7 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Amigo3Q8C2S7 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Amigo3Q8C2S7 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Amigo3Q8C2S7 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Amigo3Q8C2S7 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Amigo3Q8C2S7 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Amigo3Q8C2S7 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Amigo3Q8C2S7 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Amigo3Q8C2S7 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Amigo3Q8C2S7 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Amigo3Q8C2S7 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms