Protein–RNA interactions for Protein: Q8C2B3

Hdac7, Histone deacetylase 7, mousemouse

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Length 938 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac7Q8C2B3 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hdac7Q8C2B3 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hdac7Q8C2B3 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hdac7Q8C2B3 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Hdac7Q8C2B3 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hdac7Q8C2B3 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hdac7Q8C2B3 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Hdac7Q8C2B3 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Hdac7Q8C2B3 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hdac7Q8C2B3 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hdac7Q8C2B3 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hdac7Q8C2B3 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hdac7Q8C2B3 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hdac7Q8C2B3 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hdac7Q8C2B3 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hdac7Q8C2B3 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hdac7Q8C2B3 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hdac7Q8C2B3 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hdac7Q8C2B3 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hdac7Q8C2B3 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hdac7Q8C2B3 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hdac7Q8C2B3 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hdac7Q8C2B3 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hdac7Q8C2B3 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hdac7Q8C2B3 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hdac7Q8C2B3 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hdac7Q8C2B3 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hdac7Q8C2B3 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hdac7Q8C2B3 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hdac7Q8C2B3 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hdac7Q8C2B3 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hdac7Q8C2B3 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hdac7Q8C2B3 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hdac7Q8C2B3 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Hdac7Q8C2B3 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hdac7Q8C2B3 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Hdac7Q8C2B3 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hdac7Q8C2B3 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hdac7Q8C2B3 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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Hdac7Q8C2B3 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hdac7Q8C2B3 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hdac7Q8C2B3 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hdac7Q8C2B3 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hdac7Q8C2B3 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hdac7Q8C2B3 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hdac7Q8C2B3 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
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Hdac7Q8C2B3 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
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Hdac7Q8C2B3 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hdac7Q8C2B3 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
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Hdac7Q8C2B3 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
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Hdac7Q8C2B3 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
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Hdac7Q8C2B3 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hdac7Q8C2B3 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
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Hdac7Q8C2B3 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hdac7Q8C2B3 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hdac7Q8C2B3 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hdac7Q8C2B3 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hdac7Q8C2B3 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hdac7Q8C2B3 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hdac7Q8C2B3 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hdac7Q8C2B3 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
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Hdac7Q8C2B3 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hdac7Q8C2B3 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hdac7Q8C2B3 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hdac7Q8C2B3 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hdac7Q8C2B3 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hdac7Q8C2B3 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hdac7Q8C2B3 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hdac7Q8C2B3 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hdac7Q8C2B3 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hdac7Q8C2B3 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hdac7Q8C2B3 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hdac7Q8C2B3 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hdac7Q8C2B3 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hdac7Q8C2B3 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hdac7Q8C2B3 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hdac7Q8C2B3 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hdac7Q8C2B3 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
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Hdac7Q8C2B3 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
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