Protein–RNA interactions for Protein: Q8C176

Taf2, Transcription initiation factor TFIID subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf2Q8C176 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Taf2Q8C176 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Taf2Q8C176 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Taf2Q8C176 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Taf2Q8C176 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Taf2Q8C176 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Taf2Q8C176 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Taf2Q8C176 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Taf2Q8C176 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Taf2Q8C176 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Taf2Q8C176 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Taf2Q8C176 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Taf2Q8C176 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Taf2Q8C176 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Taf2Q8C176 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Taf2Q8C176 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Taf2Q8C176 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Taf2Q8C176 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Taf2Q8C176 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Taf2Q8C176 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Taf2Q8C176 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Taf2Q8C176 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Taf2Q8C176 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Taf2Q8C176 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Taf2Q8C176 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Taf2Q8C176 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Taf2Q8C176 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Taf2Q8C176 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Taf2Q8C176 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Taf2Q8C176 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Taf2Q8C176 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Taf2Q8C176 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Taf2Q8C176 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Taf2Q8C176 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Taf2Q8C176 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Taf2Q8C176 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Taf2Q8C176 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Taf2Q8C176 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Taf2Q8C176 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Taf2Q8C176 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Taf2Q8C176 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Taf2Q8C176 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Taf2Q8C176 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Taf2Q8C176 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Taf2Q8C176 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Taf2Q8C176 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Taf2Q8C176 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Taf2Q8C176 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Taf2Q8C176 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Taf2Q8C176 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Taf2Q8C176 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Taf2Q8C176 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Taf2Q8C176 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Taf2Q8C176 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Taf2Q8C176 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Taf2Q8C176 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Taf2Q8C176 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Taf2Q8C176 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Taf2Q8C176 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Taf2Q8C176 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Taf2Q8C176 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Taf2Q8C176 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Taf2Q8C176 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Taf2Q8C176 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Taf2Q8C176 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Taf2Q8C176 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Taf2Q8C176 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Taf2Q8C176 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Taf2Q8C176 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Taf2Q8C176 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Taf2Q8C176 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Taf2Q8C176 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Taf2Q8C176 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Taf2Q8C176 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Taf2Q8C176 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Taf2Q8C176 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Taf2Q8C176 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Taf2Q8C176 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Taf2Q8C176 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Taf2Q8C176 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Taf2Q8C176 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Taf2Q8C176 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Taf2Q8C176 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Taf2Q8C176 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Taf2Q8C176 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Taf2Q8C176 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Taf2Q8C176 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Taf2Q8C176 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Taf2Q8C176 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Taf2Q8C176 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Taf2Q8C176 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Taf2Q8C176 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Taf2Q8C176 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Taf2Q8C176 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Taf2Q8C176 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Taf2Q8C176 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Taf2Q8C176 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Taf2Q8C176 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Taf2Q8C176 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Taf2Q8C176 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms