Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0Q3

Ttc34, Tetratricopeptide repeat protein 34, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc34Q8C0Q3 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ttc34Q8C0Q3 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ttc34Q8C0Q3 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ttc34Q8C0Q3 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ttc34Q8C0Q3 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ttc34Q8C0Q3 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ttc34Q8C0Q3 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ttc34Q8C0Q3 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ttc34Q8C0Q3 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ttc34Q8C0Q3 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ttc34Q8C0Q3 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ttc34Q8C0Q3 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ttc34Q8C0Q3 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ttc34Q8C0Q3 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ttc34Q8C0Q3 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ttc34Q8C0Q3 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ttc34Q8C0Q3 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ttc34Q8C0Q3 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ttc34Q8C0Q3 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ttc34Q8C0Q3 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ttc34Q8C0Q3 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ttc34Q8C0Q3 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ttc34Q8C0Q3 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ttc34Q8C0Q3 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ttc34Q8C0Q3 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ttc34Q8C0Q3 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ttc34Q8C0Q3 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ttc34Q8C0Q3 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ttc34Q8C0Q3 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ttc34Q8C0Q3 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ttc34Q8C0Q3 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ttc34Q8C0Q3 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ttc34Q8C0Q3 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ttc34Q8C0Q3 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ttc34Q8C0Q3 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ttc34Q8C0Q3 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ttc34Q8C0Q3 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ttc34Q8C0Q3 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ttc34Q8C0Q3 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ttc34Q8C0Q3 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ttc34Q8C0Q3 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ttc34Q8C0Q3 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ttc34Q8C0Q3 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ttc34Q8C0Q3 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ttc34Q8C0Q3 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ttc34Q8C0Q3 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ttc34Q8C0Q3 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ttc34Q8C0Q3 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ttc34Q8C0Q3 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ttc34Q8C0Q3 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ttc34Q8C0Q3 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ttc34Q8C0Q3 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ttc34Q8C0Q3 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ttc34Q8C0Q3 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ttc34Q8C0Q3 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ttc34Q8C0Q3 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ttc34Q8C0Q3 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ttc34Q8C0Q3 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ttc34Q8C0Q3 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ttc34Q8C0Q3 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ttc34Q8C0Q3 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ttc34Q8C0Q3 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ttc34Q8C0Q3 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttc34Q8C0Q3 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttc34Q8C0Q3 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttc34Q8C0Q3 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttc34Q8C0Q3 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttc34Q8C0Q3 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttc34Q8C0Q3 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttc34Q8C0Q3 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttc34Q8C0Q3 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttc34Q8C0Q3 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttc34Q8C0Q3 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttc34Q8C0Q3 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttc34Q8C0Q3 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttc34Q8C0Q3 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttc34Q8C0Q3 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttc34Q8C0Q3 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttc34Q8C0Q3 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttc34Q8C0Q3 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttc34Q8C0Q3 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttc34Q8C0Q3 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttc34Q8C0Q3 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttc34Q8C0Q3 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttc34Q8C0Q3 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttc34Q8C0Q3 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttc34Q8C0Q3 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttc34Q8C0Q3 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttc34Q8C0Q3 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttc34Q8C0Q3 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttc34Q8C0Q3 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttc34Q8C0Q3 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttc34Q8C0Q3 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttc34Q8C0Q3 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttc34Q8C0Q3 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttc34Q8C0Q3 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttc34Q8C0Q3 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttc34Q8C0Q3 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttc34Q8C0Q3 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttc34Q8C0Q3 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms