Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0J2

Atg16l1, Autophagy-related protein 16-1, mousemouse

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l1Q8C0J2 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atg16l1Q8C0J2 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atg16l1Q8C0J2 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atg16l1Q8C0J2 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Atg16l1Q8C0J2 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Atg16l1Q8C0J2 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atg16l1Q8C0J2 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atg16l1Q8C0J2 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atg16l1Q8C0J2 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atg16l1Q8C0J2 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atg16l1Q8C0J2 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atg16l1Q8C0J2 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atg16l1Q8C0J2 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atg16l1Q8C0J2 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atg16l1Q8C0J2 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atg16l1Q8C0J2 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atg16l1Q8C0J2 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atg16l1Q8C0J2 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Atg16l1Q8C0J2 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Atg16l1Q8C0J2 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Atg16l1Q8C0J2 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Atg16l1Q8C0J2 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Atg16l1Q8C0J2 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Atg16l1Q8C0J2 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Atg16l1Q8C0J2 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atg16l1Q8C0J2 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atg16l1Q8C0J2 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Atg16l1Q8C0J2 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atg16l1Q8C0J2 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atg16l1Q8C0J2 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atg16l1Q8C0J2 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atg16l1Q8C0J2 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atg16l1Q8C0J2 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atg16l1Q8C0J2 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atg16l1Q8C0J2 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atg16l1Q8C0J2 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atg16l1Q8C0J2 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atg16l1Q8C0J2 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atg16l1Q8C0J2 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atg16l1Q8C0J2 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atg16l1Q8C0J2 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atg16l1Q8C0J2 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atg16l1Q8C0J2 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg16l1Q8C0J2 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg16l1Q8C0J2 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg16l1Q8C0J2 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg16l1Q8C0J2 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg16l1Q8C0J2 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg16l1Q8C0J2 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg16l1Q8C0J2 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg16l1Q8C0J2 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg16l1Q8C0J2 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg16l1Q8C0J2 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg16l1Q8C0J2 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg16l1Q8C0J2 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg16l1Q8C0J2 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg16l1Q8C0J2 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg16l1Q8C0J2 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg16l1Q8C0J2 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg16l1Q8C0J2 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg16l1Q8C0J2 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg16l1Q8C0J2 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg16l1Q8C0J2 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg16l1Q8C0J2 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg16l1Q8C0J2 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg16l1Q8C0J2 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg16l1Q8C0J2 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg16l1Q8C0J2 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg16l1Q8C0J2 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg16l1Q8C0J2 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg16l1Q8C0J2 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg16l1Q8C0J2 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg16l1Q8C0J2 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg16l1Q8C0J2 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg16l1Q8C0J2 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg16l1Q8C0J2 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg16l1Q8C0J2 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg16l1Q8C0J2 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg16l1Q8C0J2 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg16l1Q8C0J2 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg16l1Q8C0J2 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg16l1Q8C0J2 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg16l1Q8C0J2 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg16l1Q8C0J2 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg16l1Q8C0J2 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg16l1Q8C0J2 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg16l1Q8C0J2 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg16l1Q8C0J2 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg16l1Q8C0J2 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg16l1Q8C0J2 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg16l1Q8C0J2 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg16l1Q8C0J2 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg16l1Q8C0J2 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg16l1Q8C0J2 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg16l1Q8C0J2 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg16l1Q8C0J2 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg16l1Q8C0J2 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg16l1Q8C0J2 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg16l1Q8C0J2 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg16l1Q8C0J2 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms