Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXK9

Clic5, Chloride intracellular channel protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clic5Q8BXK9 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clic5Q8BXK9 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clic5Q8BXK9 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clic5Q8BXK9 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clic5Q8BXK9 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clic5Q8BXK9 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clic5Q8BXK9 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clic5Q8BXK9 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clic5Q8BXK9 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clic5Q8BXK9 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Clic5Q8BXK9 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clic5Q8BXK9 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clic5Q8BXK9 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clic5Q8BXK9 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clic5Q8BXK9 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clic5Q8BXK9 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clic5Q8BXK9 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clic5Q8BXK9 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clic5Q8BXK9 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clic5Q8BXK9 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clic5Q8BXK9 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clic5Q8BXK9 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clic5Q8BXK9 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clic5Q8BXK9 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clic5Q8BXK9 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clic5Q8BXK9 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clic5Q8BXK9 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Clic5Q8BXK9 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clic5Q8BXK9 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clic5Q8BXK9 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clic5Q8BXK9 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clic5Q8BXK9 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clic5Q8BXK9 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clic5Q8BXK9 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clic5Q8BXK9 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Clic5Q8BXK9 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Clic5Q8BXK9 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Clic5Q8BXK9 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Clic5Q8BXK9 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clic5Q8BXK9 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clic5Q8BXK9 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Clic5Q8BXK9 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clic5Q8BXK9 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clic5Q8BXK9 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clic5Q8BXK9 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clic5Q8BXK9 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clic5Q8BXK9 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clic5Q8BXK9 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clic5Q8BXK9 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clic5Q8BXK9 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clic5Q8BXK9 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clic5Q8BXK9 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clic5Q8BXK9 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clic5Q8BXK9 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clic5Q8BXK9 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clic5Q8BXK9 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clic5Q8BXK9 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clic5Q8BXK9 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clic5Q8BXK9 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clic5Q8BXK9 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clic5Q8BXK9 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clic5Q8BXK9 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clic5Q8BXK9 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clic5Q8BXK9 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clic5Q8BXK9 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clic5Q8BXK9 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clic5Q8BXK9 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clic5Q8BXK9 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clic5Q8BXK9 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clic5Q8BXK9 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clic5Q8BXK9 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clic5Q8BXK9 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clic5Q8BXK9 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clic5Q8BXK9 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clic5Q8BXK9 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clic5Q8BXK9 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clic5Q8BXK9 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clic5Q8BXK9 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clic5Q8BXK9 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clic5Q8BXK9 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clic5Q8BXK9 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clic5Q8BXK9 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clic5Q8BXK9 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clic5Q8BXK9 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clic5Q8BXK9 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clic5Q8BXK9 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clic5Q8BXK9 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clic5Q8BXK9 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clic5Q8BXK9 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clic5Q8BXK9 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clic5Q8BXK9 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clic5Q8BXK9 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clic5Q8BXK9 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clic5Q8BXK9 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clic5Q8BXK9 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clic5Q8BXK9 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clic5Q8BXK9 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clic5Q8BXK9 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Clic5Q8BXK9 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clic5Q8BXK9 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms