Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX09

Rbbp5, Retinoblastoma-binding protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 538 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp5Q8BX09 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rbbp5Q8BX09 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rbbp5Q8BX09 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rbbp5Q8BX09 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rbbp5Q8BX09 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rbbp5Q8BX09 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rbbp5Q8BX09 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rbbp5Q8BX09 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rbbp5Q8BX09 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rbbp5Q8BX09 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rbbp5Q8BX09 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rbbp5Q8BX09 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Rbbp5Q8BX09 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rbbp5Q8BX09 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rbbp5Q8BX09 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rbbp5Q8BX09 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Rbbp5Q8BX09 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rbbp5Q8BX09 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rbbp5Q8BX09 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rbbp5Q8BX09 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rbbp5Q8BX09 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rbbp5Q8BX09 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rbbp5Q8BX09 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rbbp5Q8BX09 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rbbp5Q8BX09 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rbbp5Q8BX09 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rbbp5Q8BX09 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rbbp5Q8BX09 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rbbp5Q8BX09 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rbbp5Q8BX09 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rbbp5Q8BX09 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rbbp5Q8BX09 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rbbp5Q8BX09 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Rbbp5Q8BX09 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rbbp5Q8BX09 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rbbp5Q8BX09 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rbbp5Q8BX09 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rbbp5Q8BX09 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rbbp5Q8BX09 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rbbp5Q8BX09 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rbbp5Q8BX09 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rbbp5Q8BX09 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rbbp5Q8BX09 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rbbp5Q8BX09 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rbbp5Q8BX09 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rbbp5Q8BX09 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rbbp5Q8BX09 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rbbp5Q8BX09 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rbbp5Q8BX09 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rbbp5Q8BX09 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rbbp5Q8BX09 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rbbp5Q8BX09 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rbbp5Q8BX09 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rbbp5Q8BX09 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Rbbp5Q8BX09 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rbbp5Q8BX09 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rbbp5Q8BX09 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rbbp5Q8BX09 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rbbp5Q8BX09 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rbbp5Q8BX09 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rbbp5Q8BX09 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rbbp5Q8BX09 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rbbp5Q8BX09 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Rbbp5Q8BX09 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rbbp5Q8BX09 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rbbp5Q8BX09 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rbbp5Q8BX09 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rbbp5Q8BX09 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rbbp5Q8BX09 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rbbp5Q8BX09 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Rbbp5Q8BX09 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rbbp5Q8BX09 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rbbp5Q8BX09 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rbbp5Q8BX09 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Rbbp5Q8BX09 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rbbp5Q8BX09 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rbbp5Q8BX09 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rbbp5Q8BX09 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rbbp5Q8BX09 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rbbp5Q8BX09 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rbbp5Q8BX09 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rbbp5Q8BX09 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rbbp5Q8BX09 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rbbp5Q8BX09 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rbbp5Q8BX09 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rbbp5Q8BX09 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rbbp5Q8BX09 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rbbp5Q8BX09 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rbbp5Q8BX09 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rbbp5Q8BX09 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rbbp5Q8BX09 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rbbp5Q8BX09 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rbbp5Q8BX09 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rbbp5Q8BX09 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rbbp5Q8BX09 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rbbp5Q8BX09 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rbbp5Q8BX09 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rbbp5Q8BX09 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rbbp5Q8BX09 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Rbbp5Q8BX09 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms