Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX07

Ctdsp2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, mousemouse

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp2Q8BX07 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ctdsp2Q8BX07 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ctdsp2Q8BX07 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ctdsp2Q8BX07 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ctdsp2Q8BX07 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ctdsp2Q8BX07 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ctdsp2Q8BX07 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ctdsp2Q8BX07 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ctdsp2Q8BX07 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ctdsp2Q8BX07 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ctdsp2Q8BX07 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ctdsp2Q8BX07 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ctdsp2Q8BX07 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ctdsp2Q8BX07 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ctdsp2Q8BX07 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ctdsp2Q8BX07 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ctdsp2Q8BX07 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ctdsp2Q8BX07 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ctdsp2Q8BX07 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ctdsp2Q8BX07 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ctdsp2Q8BX07 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ctdsp2Q8BX07 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ctdsp2Q8BX07 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ctdsp2Q8BX07 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ctdsp2Q8BX07 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ctdsp2Q8BX07 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ctdsp2Q8BX07 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ctdsp2Q8BX07 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ctdsp2Q8BX07 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ctdsp2Q8BX07 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ctdsp2Q8BX07 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ctdsp2Q8BX07 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ctdsp2Q8BX07 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ctdsp2Q8BX07 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ctdsp2Q8BX07 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ctdsp2Q8BX07 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ctdsp2Q8BX07 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ctdsp2Q8BX07 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ctdsp2Q8BX07 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ctdsp2Q8BX07 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ctdsp2Q8BX07 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ctdsp2Q8BX07 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ctdsp2Q8BX07 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ctdsp2Q8BX07 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ctdsp2Q8BX07 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ctdsp2Q8BX07 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ctdsp2Q8BX07 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ctdsp2Q8BX07 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ctdsp2Q8BX07 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ctdsp2Q8BX07 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ctdsp2Q8BX07 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ctdsp2Q8BX07 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ctdsp2Q8BX07 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ctdsp2Q8BX07 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ctdsp2Q8BX07 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Ctdsp2Q8BX07 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ctdsp2Q8BX07 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ctdsp2Q8BX07 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Ctdsp2Q8BX07 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ctdsp2Q8BX07 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Ctdsp2Q8BX07 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Ctdsp2Q8BX07 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ctdsp2Q8BX07 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ctdsp2Q8BX07 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ctdsp2Q8BX07 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ctdsp2Q8BX07 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ctdsp2Q8BX07 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ctdsp2Q8BX07 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ctdsp2Q8BX07 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ctdsp2Q8BX07 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ctdsp2Q8BX07 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ctdsp2Q8BX07 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ctdsp2Q8BX07 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ctdsp2Q8BX07 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ctdsp2Q8BX07 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ctdsp2Q8BX07 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ctdsp2Q8BX07 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ctdsp2Q8BX07 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ctdsp2Q8BX07 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ctdsp2Q8BX07 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Ctdsp2Q8BX07 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ctdsp2Q8BX07 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ctdsp2Q8BX07 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ctdsp2Q8BX07 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ctdsp2Q8BX07 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ctdsp2Q8BX07 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ctdsp2Q8BX07 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ctdsp2Q8BX07 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ctdsp2Q8BX07 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ctdsp2Q8BX07 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ctdsp2Q8BX07 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ctdsp2Q8BX07 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ctdsp2Q8BX07 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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