Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVL3

Snx17, Sorting nexin-17, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx17Q8BVL3 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snx17Q8BVL3 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snx17Q8BVL3 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snx17Q8BVL3 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snx17Q8BVL3 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snx17Q8BVL3 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snx17Q8BVL3 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snx17Q8BVL3 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snx17Q8BVL3 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snx17Q8BVL3 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snx17Q8BVL3 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snx17Q8BVL3 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snx17Q8BVL3 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snx17Q8BVL3 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Snx17Q8BVL3 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snx17Q8BVL3 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snx17Q8BVL3 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snx17Q8BVL3 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snx17Q8BVL3 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snx17Q8BVL3 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snx17Q8BVL3 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snx17Q8BVL3 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snx17Q8BVL3 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snx17Q8BVL3 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snx17Q8BVL3 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snx17Q8BVL3 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snx17Q8BVL3 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snx17Q8BVL3 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snx17Q8BVL3 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snx17Q8BVL3 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snx17Q8BVL3 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snx17Q8BVL3 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snx17Q8BVL3 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snx17Q8BVL3 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snx17Q8BVL3 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snx17Q8BVL3 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snx17Q8BVL3 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snx17Q8BVL3 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snx17Q8BVL3 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snx17Q8BVL3 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snx17Q8BVL3 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snx17Q8BVL3 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Snx17Q8BVL3 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snx17Q8BVL3 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snx17Q8BVL3 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snx17Q8BVL3 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snx17Q8BVL3 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snx17Q8BVL3 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snx17Q8BVL3 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snx17Q8BVL3 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Snx17Q8BVL3 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Snx17Q8BVL3 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Snx17Q8BVL3 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Snx17Q8BVL3 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Snx17Q8BVL3 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Snx17Q8BVL3 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Snx17Q8BVL3 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Snx17Q8BVL3 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Snx17Q8BVL3 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Snx17Q8BVL3 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Snx17Q8BVL3 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Snx17Q8BVL3 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Snx17Q8BVL3 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Snx17Q8BVL3 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Snx17Q8BVL3 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Snx17Q8BVL3 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Snx17Q8BVL3 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Snx17Q8BVL3 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Snx17Q8BVL3 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Snx17Q8BVL3 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Snx17Q8BVL3 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Snx17Q8BVL3 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Snx17Q8BVL3 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Snx17Q8BVL3 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Snx17Q8BVL3 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Snx17Q8BVL3 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snx17Q8BVL3 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snx17Q8BVL3 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snx17Q8BVL3 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snx17Q8BVL3 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snx17Q8BVL3 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snx17Q8BVL3 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snx17Q8BVL3 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snx17Q8BVL3 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snx17Q8BVL3 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snx17Q8BVL3 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snx17Q8BVL3 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snx17Q8BVL3 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snx17Q8BVL3 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snx17Q8BVL3 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snx17Q8BVL3 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snx17Q8BVL3 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snx17Q8BVL3 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Snx17Q8BVL3 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Snx17Q8BVL3 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Snx17Q8BVL3 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Snx17Q8BVL3 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Snx17Q8BVL3 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Snx17Q8BVL3 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Snx17Q8BVL3 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.8 ms