Protein–RNA interactions for Protein: Q8BV16

Zfp398, Zinc finger protein 398, mousemouse

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp398Q8BV16 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp398Q8BV16 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp398Q8BV16 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp398Q8BV16 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp398Q8BV16 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp398Q8BV16 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp398Q8BV16 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp398Q8BV16 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp398Q8BV16 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp398Q8BV16 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp398Q8BV16 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp398Q8BV16 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zfp398Q8BV16 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Zfp398Q8BV16 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zfp398Q8BV16 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zfp398Q8BV16 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zfp398Q8BV16 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zfp398Q8BV16 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zfp398Q8BV16 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zfp398Q8BV16 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zfp398Q8BV16 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zfp398Q8BV16 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zfp398Q8BV16 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zfp398Q8BV16 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zfp398Q8BV16 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zfp398Q8BV16 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zfp398Q8BV16 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zfp398Q8BV16 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zfp398Q8BV16 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zfp398Q8BV16 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Zfp398Q8BV16 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zfp398Q8BV16 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zfp398Q8BV16 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zfp398Q8BV16 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zfp398Q8BV16 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zfp398Q8BV16 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zfp398Q8BV16 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zfp398Q8BV16 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zfp398Q8BV16 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zfp398Q8BV16 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zfp398Q8BV16 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zfp398Q8BV16 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zfp398Q8BV16 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zfp398Q8BV16 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zfp398Q8BV16 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zfp398Q8BV16 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zfp398Q8BV16 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zfp398Q8BV16 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zfp398Q8BV16 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zfp398Q8BV16 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Zfp398Q8BV16 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zfp398Q8BV16 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zfp398Q8BV16 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zfp398Q8BV16 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zfp398Q8BV16 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zfp398Q8BV16 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zfp398Q8BV16 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zfp398Q8BV16 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zfp398Q8BV16 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zfp398Q8BV16 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zfp398Q8BV16 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zfp398Q8BV16 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zfp398Q8BV16 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zfp398Q8BV16 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Zfp398Q8BV16 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zfp398Q8BV16 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Zfp398Q8BV16 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zfp398Q8BV16 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zfp398Q8BV16 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zfp398Q8BV16 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zfp398Q8BV16 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zfp398Q8BV16 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zfp398Q8BV16 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zfp398Q8BV16 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zfp398Q8BV16 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zfp398Q8BV16 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zfp398Q8BV16 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zfp398Q8BV16 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zfp398Q8BV16 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zfp398Q8BV16 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zfp398Q8BV16 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Zfp398Q8BV16 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zfp398Q8BV16 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zfp398Q8BV16 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zfp398Q8BV16 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zfp398Q8BV16 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zfp398Q8BV16 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zfp398Q8BV16 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zfp398Q8BV16 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zfp398Q8BV16 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zfp398Q8BV16 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zfp398Q8BV16 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Zfp398Q8BV16 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zfp398Q8BV16 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zfp398Q8BV16 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zfp398Q8BV16 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zfp398Q8BV16 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zfp398Q8BV16 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zfp398Q8BV16 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zfp398Q8BV16 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms