Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMQ3

Bnc2, Zinc finger protein basonuclin-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,127 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bnc2Q8BMQ3 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Bnc2Q8BMQ3 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Bnc2Q8BMQ3 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Bnc2Q8BMQ3 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Bnc2Q8BMQ3 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Bnc2Q8BMQ3 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Bnc2Q8BMQ3 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Bnc2Q8BMQ3 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Bnc2Q8BMQ3 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Bnc2Q8BMQ3 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Bnc2Q8BMQ3 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Bnc2Q8BMQ3 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Bnc2Q8BMQ3 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Bnc2Q8BMQ3 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Bnc2Q8BMQ3 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Bnc2Q8BMQ3 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Bnc2Q8BMQ3 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Bnc2Q8BMQ3 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Bnc2Q8BMQ3 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Bnc2Q8BMQ3 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Bnc2Q8BMQ3 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Bnc2Q8BMQ3 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Bnc2Q8BMQ3 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Bnc2Q8BMQ3 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Bnc2Q8BMQ3 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Bnc2Q8BMQ3 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bnc2Q8BMQ3 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bnc2Q8BMQ3 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bnc2Q8BMQ3 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bnc2Q8BMQ3 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bnc2Q8BMQ3 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bnc2Q8BMQ3 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Bnc2Q8BMQ3 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bnc2Q8BMQ3 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bnc2Q8BMQ3 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bnc2Q8BMQ3 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bnc2Q8BMQ3 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Bnc2Q8BMQ3 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bnc2Q8BMQ3 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bnc2Q8BMQ3 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bnc2Q8BMQ3 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bnc2Q8BMQ3 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bnc2Q8BMQ3 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bnc2Q8BMQ3 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bnc2Q8BMQ3 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bnc2Q8BMQ3 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bnc2Q8BMQ3 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Bnc2Q8BMQ3 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Bnc2Q8BMQ3 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Bnc2Q8BMQ3 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Bnc2Q8BMQ3 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Bnc2Q8BMQ3 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Bnc2Q8BMQ3 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Bnc2Q8BMQ3 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Bnc2Q8BMQ3 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Bnc2Q8BMQ3 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Bnc2Q8BMQ3 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Bnc2Q8BMQ3 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Bnc2Q8BMQ3 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Bnc2Q8BMQ3 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Bnc2Q8BMQ3 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Bnc2Q8BMQ3 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Bnc2Q8BMQ3 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Bnc2Q8BMQ3 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Bnc2Q8BMQ3 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Bnc2Q8BMQ3 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Bnc2Q8BMQ3 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Bnc2Q8BMQ3 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Bnc2Q8BMQ3 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Bnc2Q8BMQ3 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Bnc2Q8BMQ3 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Bnc2Q8BMQ3 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bnc2Q8BMQ3 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bnc2Q8BMQ3 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bnc2Q8BMQ3 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bnc2Q8BMQ3 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bnc2Q8BMQ3 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bnc2Q8BMQ3 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bnc2Q8BMQ3 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bnc2Q8BMQ3 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bnc2Q8BMQ3 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bnc2Q8BMQ3 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bnc2Q8BMQ3 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bnc2Q8BMQ3 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Bnc2Q8BMQ3 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bnc2Q8BMQ3 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bnc2Q8BMQ3 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bnc2Q8BMQ3 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bnc2Q8BMQ3 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Bnc2Q8BMQ3 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bnc2Q8BMQ3 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bnc2Q8BMQ3 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Bnc2Q8BMQ3 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bnc2Q8BMQ3 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bnc2Q8BMQ3 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bnc2Q8BMQ3 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bnc2Q8BMQ3 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bnc2Q8BMQ3 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bnc2Q8BMQ3 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bnc2Q8BMQ3 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms