Protein–RNA interactions for Protein: Q8BL06

Usp54, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp54Q8BL06 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Usp54Q8BL06 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Usp54Q8BL06 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Usp54Q8BL06 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Usp54Q8BL06 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Usp54Q8BL06 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Usp54Q8BL06 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Usp54Q8BL06 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Usp54Q8BL06 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Usp54Q8BL06 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Usp54Q8BL06 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Usp54Q8BL06 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Usp54Q8BL06 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Usp54Q8BL06 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Usp54Q8BL06 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Usp54Q8BL06 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Usp54Q8BL06 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Usp54Q8BL06 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Usp54Q8BL06 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Usp54Q8BL06 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Usp54Q8BL06 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Usp54Q8BL06 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Usp54Q8BL06 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Usp54Q8BL06 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Usp54Q8BL06 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Usp54Q8BL06 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Usp54Q8BL06 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Usp54Q8BL06 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Usp54Q8BL06 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Usp54Q8BL06 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Usp54Q8BL06 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Usp54Q8BL06 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Usp54Q8BL06 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Usp54Q8BL06 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Usp54Q8BL06 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Usp54Q8BL06 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Usp54Q8BL06 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Usp54Q8BL06 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Usp54Q8BL06 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Usp54Q8BL06 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Usp54Q8BL06 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Usp54Q8BL06 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Usp54Q8BL06 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Usp54Q8BL06 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Usp54Q8BL06 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Usp54Q8BL06 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Usp54Q8BL06 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Usp54Q8BL06 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Usp54Q8BL06 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Usp54Q8BL06 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Usp54Q8BL06 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Usp54Q8BL06 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Usp54Q8BL06 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Usp54Q8BL06 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Usp54Q8BL06 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Usp54Q8BL06 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Usp54Q8BL06 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Usp54Q8BL06 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Usp54Q8BL06 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Usp54Q8BL06 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Usp54Q8BL06 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Usp54Q8BL06 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Usp54Q8BL06 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Usp54Q8BL06 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Usp54Q8BL06 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Usp54Q8BL06 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Usp54Q8BL06 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Usp54Q8BL06 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Usp54Q8BL06 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Usp54Q8BL06 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Usp54Q8BL06 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Usp54Q8BL06 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Usp54Q8BL06 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Usp54Q8BL06 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Usp54Q8BL06 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Usp54Q8BL06 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Usp54Q8BL06 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Usp54Q8BL06 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Usp54Q8BL06 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Usp54Q8BL06 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Usp54Q8BL06 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Usp54Q8BL06 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Usp54Q8BL06 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp54Q8BL06 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp54Q8BL06 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp54Q8BL06 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp54Q8BL06 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp54Q8BL06 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp54Q8BL06 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp54Q8BL06 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp54Q8BL06 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp54Q8BL06 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp54Q8BL06 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp54Q8BL06 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp54Q8BL06 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp54Q8BL06 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp54Q8BL06 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp54Q8BL06 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp54Q8BL06 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp54Q8BL06 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms