Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKW4

Zcchc4, Zinc finger CCHC domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc4Q8BKW4 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zcchc4Q8BKW4 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zcchc4Q8BKW4 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zcchc4Q8BKW4 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zcchc4Q8BKW4 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zcchc4Q8BKW4 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Zcchc4Q8BKW4 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Zcchc4Q8BKW4 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Zcchc4Q8BKW4 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Zcchc4Q8BKW4 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Zcchc4Q8BKW4 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Zcchc4Q8BKW4 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Zcchc4Q8BKW4 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zcchc4Q8BKW4 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zcchc4Q8BKW4 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zcchc4Q8BKW4 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zcchc4Q8BKW4 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zcchc4Q8BKW4 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zcchc4Q8BKW4 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zcchc4Q8BKW4 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zcchc4Q8BKW4 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Zcchc4Q8BKW4 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zcchc4Q8BKW4 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zcchc4Q8BKW4 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zcchc4Q8BKW4 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zcchc4Q8BKW4 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zcchc4Q8BKW4 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Zcchc4Q8BKW4 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zcchc4Q8BKW4 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zcchc4Q8BKW4 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zcchc4Q8BKW4 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zcchc4Q8BKW4 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zcchc4Q8BKW4 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zcchc4Q8BKW4 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zcchc4Q8BKW4 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zcchc4Q8BKW4 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zcchc4Q8BKW4 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zcchc4Q8BKW4 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zcchc4Q8BKW4 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zcchc4Q8BKW4 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Zcchc4Q8BKW4 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zcchc4Q8BKW4 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zcchc4Q8BKW4 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zcchc4Q8BKW4 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zcchc4Q8BKW4 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zcchc4Q8BKW4 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zcchc4Q8BKW4 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zcchc4Q8BKW4 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zcchc4Q8BKW4 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zcchc4Q8BKW4 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zcchc4Q8BKW4 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zcchc4Q8BKW4 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zcchc4Q8BKW4 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zcchc4Q8BKW4 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zcchc4Q8BKW4 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zcchc4Q8BKW4 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zcchc4Q8BKW4 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zcchc4Q8BKW4 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zcchc4Q8BKW4 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zcchc4Q8BKW4 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zcchc4Q8BKW4 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zcchc4Q8BKW4 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zcchc4Q8BKW4 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zcchc4Q8BKW4 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zcchc4Q8BKW4 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zcchc4Q8BKW4 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zcchc4Q8BKW4 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zcchc4Q8BKW4 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zcchc4Q8BKW4 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zcchc4Q8BKW4 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zcchc4Q8BKW4 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zcchc4Q8BKW4 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zcchc4Q8BKW4 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zcchc4Q8BKW4 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zcchc4Q8BKW4 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Zcchc4Q8BKW4 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zcchc4Q8BKW4 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Zcchc4Q8BKW4 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zcchc4Q8BKW4 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Zcchc4Q8BKW4 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zcchc4Q8BKW4 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zcchc4Q8BKW4 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zcchc4Q8BKW4 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zcchc4Q8BKW4 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zcchc4Q8BKW4 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zcchc4Q8BKW4 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zcchc4Q8BKW4 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zcchc4Q8BKW4 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zcchc4Q8BKW4 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zcchc4Q8BKW4 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zcchc4Q8BKW4 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zcchc4Q8BKW4 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zcchc4Q8BKW4 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zcchc4Q8BKW4 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zcchc4Q8BKW4 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zcchc4Q8BKW4 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zcchc4Q8BKW4 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zcchc4Q8BKW4 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zcchc4Q8BKW4 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zcchc4Q8BKW4 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms