Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKV1

Gpc2, Glypican-2, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc2Q8BKV1 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gpc2Q8BKV1 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Gpc2Q8BKV1 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gpc2Q8BKV1 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gpc2Q8BKV1 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Gpc2Q8BKV1 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gpc2Q8BKV1 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gpc2Q8BKV1 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gpc2Q8BKV1 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Gpc2Q8BKV1 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gpc2Q8BKV1 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gpc2Q8BKV1 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gpc2Q8BKV1 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gpc2Q8BKV1 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gpc2Q8BKV1 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gpc2Q8BKV1 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gpc2Q8BKV1 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gpc2Q8BKV1 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gpc2Q8BKV1 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gpc2Q8BKV1 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gpc2Q8BKV1 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gpc2Q8BKV1 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gpc2Q8BKV1 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gpc2Q8BKV1 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gpc2Q8BKV1 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Gpc2Q8BKV1 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Gpc2Q8BKV1 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gpc2Q8BKV1 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gpc2Q8BKV1 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gpc2Q8BKV1 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gpc2Q8BKV1 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gpc2Q8BKV1 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gpc2Q8BKV1 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Gpc2Q8BKV1 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gpc2Q8BKV1 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gpc2Q8BKV1 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gpc2Q8BKV1 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gpc2Q8BKV1 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gpc2Q8BKV1 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gpc2Q8BKV1 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gpc2Q8BKV1 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gpc2Q8BKV1 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gpc2Q8BKV1 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gpc2Q8BKV1 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gpc2Q8BKV1 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gpc2Q8BKV1 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gpc2Q8BKV1 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gpc2Q8BKV1 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gpc2Q8BKV1 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gpc2Q8BKV1 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gpc2Q8BKV1 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gpc2Q8BKV1 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gpc2Q8BKV1 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gpc2Q8BKV1 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gpc2Q8BKV1 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gpc2Q8BKV1 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Gpc2Q8BKV1 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gpc2Q8BKV1 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gpc2Q8BKV1 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gpc2Q8BKV1 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gpc2Q8BKV1 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gpc2Q8BKV1 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gpc2Q8BKV1 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gpc2Q8BKV1 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gpc2Q8BKV1 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gpc2Q8BKV1 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gpc2Q8BKV1 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gpc2Q8BKV1 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gpc2Q8BKV1 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gpc2Q8BKV1 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Gpc2Q8BKV1 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gpc2Q8BKV1 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gpc2Q8BKV1 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gpc2Q8BKV1 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gpc2Q8BKV1 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gpc2Q8BKV1 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gpc2Q8BKV1 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Gpc2Q8BKV1 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Gpc2Q8BKV1 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Gpc2Q8BKV1 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Gpc2Q8BKV1 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gpc2Q8BKV1 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Gpc2Q8BKV1 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gpc2Q8BKV1 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gpc2Q8BKV1 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gpc2Q8BKV1 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gpc2Q8BKV1 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gpc2Q8BKV1 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gpc2Q8BKV1 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gpc2Q8BKV1 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gpc2Q8BKV1 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gpc2Q8BKV1 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gpc2Q8BKV1 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gpc2Q8BKV1 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gpc2Q8BKV1 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gpc2Q8BKV1 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gpc2Q8BKV1 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gpc2Q8BKV1 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gpc2Q8BKV1 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Gpc2Q8BKV1 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms